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发明专利 CN201710952835.0
摘要:本发明属于生物医药领域,具体涉及血清miRNAs生物标志物及其筛选方法和应用,其筛选方法包括以下步骤:1)从血清中提取包括miRNAs在内的总RNA;2)比较慢乙肝和慢乙肝后肝硬化患者的miRNAs表达谱,找出肝硬化患者血清中异常表达的miRNAs;3)用实时定量RT‑PCR方法,经小样本初筛及扩大样本验证,筛选可用作肝硬化标志物的miRNAs;4)ROC曲线进行相关分析。本发明筛选的慢乙肝后肝硬化辅助诊断标志物为miR‑27a,在肝硬化患者血清中呈高表达,并影响肝星状细胞的增殖,具有潜在诊断和治疗价值,且样本易得、收集简便、无创,具有重要的学术意义和广阔的应用前景。
发明专利 CN201710949228.9
摘要:本发明公开了一种ctDNA精准测序的扩增子文库构建方法,包括以下步骤:S01:cfDNA随机连接再随机片段化并加接头建库;S02:cfDNA非靶向/靶向文库扩增。本发明解决了:(1)外源标签法需合成大量的标签序列成本较高的问题;(2)低丰度的cfDNA片段小且断裂位点随机分布条件下,设计目的基因的特征引物经常无法扩出目标序列的问题。
发明专利 CN201710874253.5
中国计量大学 2017-09-25
摘要:本发明涉及分子生物学领域,具体公开了一种低温胁迫下福寿螺SSH文库的构建、鉴定方法。方法包括如下步骤:(1)福寿螺低温胁迫处理;(2)福寿螺样品处理;(3)福寿螺组织总RNA提取;(4)反转录合成cDNA;(5)cDNA纯化;(6)cDNA酶切及纯化;(7)接头连接;(8)消减杂交;(9)差减PCR鉴定及纯化;(10)PCR产物与pMD18‑T载体连接;(11)连接产物转化大肠杆菌DH5a;(12)文库鉴定;本发明方法所构建的低温胁迫下福寿螺SSH文库,为大量发现和研究入侵生物福寿螺的表达基因奠定基础。同时,本发明的SSH文库对于深入研究入侵生物福寿类的耐逆机制具有重要的理论及实际意义。
发明专利 CN201710864035.3
摘要:本发明涉及分子生物学技术领域,具体公开了一种适用于单细胞RRBS测序的文库建立方法及其应用。本发明公开的适用于单细胞RRBS测序的文库建立方法包括如下步骤:(1)对样本的基因组DNA依次进行酶切、末端补平和加A、加接头以及重亚硫酸盐转化;(2)对步骤(1)中转化后的基因组DNA进行线性扩增;(3)对步骤(2)中线性扩增的扩增子进行指数扩增,所述指数扩增的扩增子用作测序文库。该方法测序所需的DNA起始量低,可以对单个细胞的基因组进行甲基化测序;具有有效的文库片段控制步骤,通过线性扩增步骤控制最终产物的片段,避免繁复操作的同时提高覆盖率。
发明专利 CN201710868656.9
摘要:本申请涉及可以检测24种肺炎致病菌耐药基因的基因芯片。这24种肺炎致病菌耐药基因来自氨基糖苷类、喹诺酮类、超广谱β内酰胺酶类(ESBLs)、头孢菌素类(AmpC)、碳青霉烯类、耐万古霉素、耐甲氧西林和导致膜通透性改变的基因,与临床关系最为密切。该基因芯片是通过反复设计和筛选,最终将灵敏度好,特异度高的探针固定在芯片上,不需要进行临床培养和药敏试验,操作简单快捷,在很大程度上为抗生素的合理使用争取了宝贵的时间,值得临床推广应用。
发明专利 CN201710868657.3
摘要:本申请涉及用于肺炎致病菌耐药基因快速检测的试剂盒,其包括能检测24个肺炎致病菌主要耐药基因的基因芯片和用于多重不对称PCR反应的反应体系。24个耐药基因来自氨基糖苷类、喹诺酮类、超广谱β内酰胺酶类(ESBLs)、头孢菌素类(AmpC)、碳青霉烯类、耐万古霉素、耐甲氧西林和导致膜通透性改变的耐药基因。该试剂盒可直接检测临床标本中肺炎致病菌的耐药基因,操作简单快捷,无需培养和药敏试验,在很大程度上为抗生素的合理使用争取了宝贵的时间,值得临床推广应用。
发明专利 CN201710846902.0
摘要:本发明公开了一种检测假肥大型肌营养不良的基因芯片、试剂盒及其使用方法,本基因芯片包括固相载体和固定在该固相载体上的寡核苷酸探针,其中寡核苷酸探针为SEQ ID NO.1‑345所示的核苷酸序列;基因芯片包含在试剂盒内。本试剂盒的使用方法包括如下步骤:(a) 制备样品DNA片段;(b) 荧光标记DNA片段;(c) 纯化gDNA标记产物;(d) 将gDNA标记产物与基因芯片杂交;(e) 洗涤杂交的基因芯片,扫描芯片杂交信号,获得结果。本发明的基因芯片和试剂盒,成本低,而且检测操作步骤简单、特异性高、稳定性好,从样本抽提到获得扫描结果可在两天内完成,适用于临床患者DMD基因内部一个或多个外显子缺失或重复突变的检测及产前诊断。
发明专利 CN201710847405.2
摘要:本发明涉及一种检测α‑地中海贫血的基因芯片及其使用方法、试剂盒,所述基因芯片包括固相载体和固定在该固相载体上的寡核苷酸探针,所述寡核苷酸探针为SEQ ID NO.1~195所示的核苷酸序列;所述使用方法包括如下步骤:(1)制备样品DNA片段;(2)荧光标记上述DNA片段;(3)纯化上述gDNA标记产物;(4)将gDNA标记产物与所述基因芯片杂交;(5)洗涤杂交的基因芯片,扫描芯片杂交信号;本发明还涉及包含前述基因芯片的试剂盒。本发明的基因芯片操作步骤简单、检测特异性高、稳定性好,从样本抽提到获得扫描结果可在两天内完成,成本低,适用于α‑地中海贫血患者缺失或重复突变检测及产前诊断。
发明专利 CN201710839703.7
东南大学 2017-09-15
摘要:一种结直肠癌诊断生物标志物及其应用,核苷酸序列如SEQ ID NO:1所示。本发明首次发现了hsa_circ_0006110基因表达与结直肠癌密切相关,通过检测受试者结直肠组织中hsa_circ_0006110的表达,可以断更加准确、快速的判断受试者是否已患有结直肠癌或是否存在患有结直肠癌的风险,从而给临床医师提供预防或治疗方案。并且作为制备治疗结直肠癌药物的靶基因为治疗结直肠癌提供了新的治疗靶点和治疗途径,与传统的检测手段相比,分子标志物的诊断更及时、更特异,从而提高结直肠癌患者的5年生存率,降低死亡率,应用前景广阔。
发明专利 CN201710804216.7
摘要:本发明提供一种准确可靠的用于循环肿瘤DNA分析的生物信息处理方法。它包括如下步骤:(1)cfDNA提取、建库及测序;(2)测序数据质控及序列比对;(3)测序数据矫正;(4)使用两款软件同时对步骤(3)得到矫正后的测序数据进行基因突变检测,并将两款软件的分析结果取并集整合;(5)利用步骤(3)矫正后的序列建立突变可信数据集,并用数据集对步骤(4)得到的突变结果提供可信度支持。本发明以cfDNA中的ctDNA为检测对象,只需要采集受试者的少量静脉外周血就可进行检测,收样简洁且方便。
发明专利 CN201710773996.3
摘要:本发明公开了一种基于少量细胞全基因组染色质高分辨率构象技术eHi‑C 2.0.本发明提供了一种细胞eHi‑C 2.0测序文库的制备方法为:裂解细胞得到染色质,再酶切所述染色质;将所述酶切后DNA依次经标记物标记和钝端连接,得到环化产物;向所述环化产物中引入内参环状共沉淀DNA分子;再用限制性外切酶酶切,再进行超声打断,再用免疫磁珠从打断产物中抓取带有所述标记物的DNA片段;用所述带有所述标记物的DNA片段制备eHi‑C 2.0测序文库。本发明能对数量低至0.1million细胞的进行全基因组染色质构象技术eHi‑C建库测序。
发明专利 CN201710771917.5
天津科技大学 2017-08-31
摘要:本发明涉及一种特异识别赭曲霉毒素A的核酸适配体及其制备方法,该单链DNA适配体的序列为序列1,本发明所述赭曲霉毒素A核酸适配体是通过基于氧化石墨烯分离的指数富集配体系统进化技术,体外筛选获得了高亲和力且特异识别OTA毒素的单链寡核苷酸适配体,具有特异性好,稳定性高,成本低廉,易于合成与修饰,使用方便,无毒等特点,可以研制出基于核酸适配体的生物传感器、固相亲和净化柱以及农产品中快速检测的分析方法等。
发明专利 CN201710757202.4
摘要:本发明属于瓜类枯萎病防治技术领域,公开了一种Fosmid文库抗瓜类枯萎病活性产物筛选与鉴定方法,包括;异位裂解法提取土壤微生物基因组DNA;宏基因组Fosmid文库构建及质量检测;筛选宏基因组Fosmid表达文库,获得Fosmid活性克隆;萃取发酵液,获得较纯的活性层;获得纯化后的抗瓜类枯萎病活性物质;解析图谱,确定活性物质结构,验证化合物抗瓜类枯萎病的活性;筛选和改造植物内生菌株,基因转化到改造后的内生菌株,通过选择不同的启动子、不同的培养基和发酵条件,建立抗瓜类枯萎病药物基因的高效表达体系。本发明突破传统生防菌不能定植的瓶颈因素,大大加速抗瓜类枯萎病新药物的研制、开发和商品化进程。
发明专利 CN201710757204.3
摘要:本发明属于微生物领域,公开了一种热带雨林土壤微生物宏基因组Fosmid文库构建方法,采用PVPP洗涤,去除杂质后,溶菌酶—蛋白酶K—SDS—CTAB裂解法,提取和纯化大片段的土壤微生物基因组DNA;经琼脂糖凝胶低电压电泳和脉冲电泳检测;末端修复宏基因组DNA,将marker和小样切下,使用连接酶将回收产物连接到Fosmid载体pCC1FOS上;连接反应在2h内完成;连接产物经λ包装提取物包装,EPI300‑T1R菌株转染,涂于含12.5μg/mL的氯霉素的LB平板上,37℃,过夜培养。本发明反映在热带雨林这一极端的环境中,微生物及其基因资源极端而丰富,有利于微生物功能基因挖掘与利用。
发明专利 CN201710708670.2
摘要:本发明公开的一种用于微量DNA高效建库的方法,包括如下步骤:(1)使用超纯T4 DNA聚合酶用于DNA末端补平和切平,提高末端修复效率;(2)使用Klenow(3’‑5’exo‑)代替Taq DNA聚合酶用于DNA末端加A尾,提高加A效率;(3)使用超纯T4 DNA连接酶用于DNA和接头之间的A/T连接,提高连接效率;(4)使用高效高保真酶进行扩增。本发明具有如下优点:针对微量DNA样本,本方法建库效率提升,样本建库转化效率>10%。
发明专利 CN201710678160.5
摘要:本发明公开了一种动物脑组织切片库的建立方法,包括以下步骤:选取合适的脑组织切片,经过长久保存的前期处理后入库,建立电子档案保存。所述合适的脑组织切片的标准如下:第一.动物灌流成功;第二.动物造模成功;第三.脑组织切片无破损。本发明的动物脑组织切片库的建立方法使得脑组织切片得到有效长久保存,珍贵脑组织材料得到充分利用,节省大量的人力物力成本,提高科研效率。
发明专利 CN201710674663.5
华子昂 2017-08-09
摘要:本发明公开一种检测大肠杆菌λ噬菌体全基因组碱基修饰单倍型的方法,该方法是先利用SMRT Portal数据分析平台,将大肠杆菌λ噬菌体基因组测序数据选择相应的Protocol协议进行数据分析,然后通过获得的包含大量碱基修饰信息的文件,利用perl语言编写代码找出经化学修饰的碱基完整信息,即包括m4C、m6A和其他碱基修饰的具体位点信息。通过该方法鉴定出的大肠杆菌λ噬菌体基因组中的碱基修饰情况,能够为在构建λ噬菌体载体中研究限制性酶切割λDNA中的效果,外源DNA连接在λDNA序列中的效率,以及在λ噬菌体基因组中有部分基因的表达与大肠杆菌密切相关等方面进一步的研究,提供更多的实用信息,提高工作效率,具有很大的应用价值。
发明专利 CN201710668581.X
摘要:本发明提供了用于构建人类线粒体DNA文库的预捕获引物、捕获探针及构建方法、测序方法和应用,涉及基因组学技术领域,本发明提供的用于构建人类线粒体DNA文库的预捕获引物和捕获探针,包括如序列表中所示的序列,能够实现对人类线粒体序列的快速捕获。本发明提供的构建方法,能够降低基因组DNA中同源序列影响线粒体序列分析的干扰,在构建文库时,只需要进行三步PCR的方法即可完成从目标序列筛选,到目标序列捕获,到接头序列引入的过程,降低了操作难度和提高了实验效率,并且,由于本发明的主要流程均在PCR仪上完成,使用试剂便捷,价格低廉,在普通实验室内即可完成。
发明专利 CN201710650277.2
摘要:本发明提供一种用于染色体异常检测的文库构建方法,通过对反应体系及反应条件的优化,实现了对羊水、脐血等少量样本的文库构建,缩短患者在临床染色体异常检测的等待时间。
发明专利 CN201710647677.8
摘要:本发明提供一种用于与微卫星不稳定性(MSI)检测相关的微卫星位点进行杂交的DNA探针库,所述DNA探针库包括一个或多个能够与MSI状态相关微卫星位点进行杂交的DNA探针。所述DNA探针中,MSI相关微卫星位点探针如以下序列所示:SEQ ID NO.1~66。此外,本发明提供利用该探针库对MSI相关微卫星位点进行富集及检测的方法,采用此方法与下一代测序技术(NGS)相结合可以极大地提高MSI检测的敏感性,准确性与全面性。
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