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发明专利 CN201810034223.8
西南大学 2018-01-15
摘要:本公开了一种PRLR基因的新应用及其方法,本发明利用Z染色体存在的176,324 bp串联重复序列与鸡快慢羽位点的连锁关系,采用荧光定量PCR方法对羽速基因候选基因PRLR和内参基因PCCA之间拷贝数变异的鉴定,反应结束后便可简洁直观的根据两者Ct值的差异判定基因型,实现同时区分鸡快慢羽基因型、慢羽纯/杂合性及雏鸡雌雄,同时本技术实验操作更为简便,可极大的降低选育快慢羽纯系鸡的育种时间与成本。
发明专利 CN201810000903.8
摘要:本发明涉及分子生物学技术领域,特别是涉及一种新型甲基化建库试剂盒及其应用。本发明提供的新型甲基化建库试剂盒,至少包括:重亚硫酸盐转化试剂、黏性末端接头、连接酶、DNA延伸试剂、以及DNA扩增试剂。本发明的甲基化建库试剂盒能应用于低起始量的样品(低至6pg),适用于包括FFPE样本等提取的质量较差的基因组DNA,极大减少了由于药物处理造成DNA断裂导致的样品信息损失,可直接通过更经济实用的普通连接酶引入带有黏末端的双链DNA接头,可增加数据的准确性,更大限度的保留样品的多样性,缩小由于人为原因造成的文库偏向性。
发明专利 CN201810000905.7
摘要:本发明涉及分子生物学技术领域,特别是涉及一种微生物多样性文库构建方法及其应用。本发明新型的微生物多样性文库构建方法,利用单链连接及特殊标签引物接头对宏基因组进行微生物多样性文库构建,该方案适用于常规样品、微量样品、FFPE样品及150个以下的少量细胞团,扩大了微生物多样性研究的应用范围;单链连接及特殊标签的引入可将不同种群目的片段进行偏向性较小的富集,保证了物种丰富性以及样本不同物种丰度的真实性。此外,还具有起始量低并可对同一样本进行多物种鉴别的优点。
发明专利 CN201810006282.4
华中农业大学 2018-01-02
摘要:本发明涉及一种单细胞甲基化测序文库的构建方法及其应用。本发明将多重置换扩增技术应用于单细胞甲基化测序文库的构建,显著扩大了测序文库的丰富度和比对率。具体是,先利用优选的重亚硫酸盐转换试剂盒产生含尿嘧啶的小片段,之后用无标签的随机引物进行数轮扩增延伸,将游离的单链小片段引物降解后,利用高温将配对双链变性,再将单链小片段连接成单链长片段,利用5’末端封闭的无标签随机引物片段进行多重置换扩增,获得扩增终产物,最终对反应产物进行基于Tn5酶的文库构建。
发明专利 CN201711482354.4
摘要:本发明属于分子生物学领域,涉及一种用于分析肠道微生物的引物组及其应用,所述引物组包括第一正向引物和第一反向引物;其中,所述第一正向引物从5’到3’端包括依次相连的五个部分:P5接头序列、第一标签序列、第一间隔序列、2bp的随机碱基序列和肠道微生物16S rRNA V3‑V4区特异性正向引物;所述第一反向引物从5’到3’端包括依次相连的五个部分:P7接头序列、第二标签序列、第二间隔序列、2bp的随机碱基序列和肠道微生物16S rRNA V3‑V4区特异性反向引物。本发明引物组合物采用一步法扩增获得测序文库,其中包含了随机碱基,增加了文库序列的复杂度,降低了phix的比例,保证更多测序质量,提高了文库的覆盖度。
发明专利 CN201711355441.3
摘要:本发明公开了一种FFPE组织样本的超低频建库方法,步骤包括:FFPE样本的DNA提取;DNA打断;去磷酸化与DNA变性;生物素UID单链接头的添加;链霉素磁珠捕获与洗脱;双链第二接头的添加与文库洗脱:通过T4DNA连接酶,在上述靶DNA分子的另一端加上第二个接头,并洗去过剩与残留的接头;LM‑PCR扩增,引入barcode;磁珠纯化PCR扩增产物。本发明针对某些严重降解的FFPE DNA微量样本实现建库捕获测序,在建库开始前通过引入UID标签接头,从而为后续排除建库、捕获以及上机测序过程中引入的技术突变提供前提条件。
发明专利 CN201711344134.5
摘要:本发明公开了一种应用于肿瘤驱动基因检测的文库构建及定量方法,包括以下步骤:S1,合成用于构建扩增子文库的引物组合;S2,合成用于构建最终待上机文库的Torrent接头引物;S3,对提取后的样本DNA进行磁珠纯化;S4,目标区域多重PCR扩增;S5,PCR添加测序接头序列;S6,链霉亲和素‑生物素捕获目的文库。本发明可以简便、快速的经过两轮PCR完成扩增子文库的构建,并且在缩短文库构建及文库定量的时间的同时极大的降低了文库构建及文库定量的成本。
发明专利 CN201711315301.3
摘要:本发明涉及用于检测基因突变的引物对组合、试剂盒以及构建文库的方法。所述试剂盒可与二代测序仪和数据分析一体机配合使用,用于检测人类33个基因的89个热点区域的突变。所述构建文库的方法包括:将本发明的引物对组合与DNA模板结合后,用高保真DNA聚合酶以脱氧核苷酸为底物,对待检基因特定区域进行体外扩增,并对扩增产物添加特定的核苷酸序列,从而获得DNA文库。
发明专利 CN201711247220.4
发明专利 CN201711233139.0
摘要:本发明涉及一种人的NDUFA13蛋白突变蛋白及其应用,通过将大量癌症患者作为研究病例,对病例进行基因检测并进行分析,确定出人的NDUFA13蛋白的突变蛋白,根据该人的NDUFA13蛋白突变蛋白制备基因芯片、单克隆抗体和ELISA试剂盒,为癌症的基因诊断提供的指引作用,实现癌症的早诊断、早发现和相关治疗。
发明专利 CN201711237602.9
摘要:本发明公开了一种新生儿50种遗传病基因检测探针组及筛查方法。本发明针对新生儿50种遗传病104种基因,并结合靶序列液相杂交捕获技术和半导体测序技术,设计了1347个探针捕获区域,基于所提供的探针捕获区域可根据常规方法设计获得相应的探针,实现新生儿50种遗传病有效筛查,其具有准确率高,特异性好,通量大的优势,拥有广阔的应用前景。
发明专利 CN201711227482.4
摘要:本发明公开了一种用于构建16S rRNA基因扩增子测序文库的四重标签引物组,所述四重标签引物组由第一步PCR两重标签引物对和第二步PCR两重标签引物对组成;所述第一步PCR两重标签引物对的上游引物的序列为SEQ ID NO:1~8中的任一条,下游引物的序列为SEQ ID NO:9~20中的任一条;所述第二步PCR两重标签引物对的上游引物的序列为SEQ ID NO:21~44中的任一条,下游引物的序列为SEQ ID NO:45~68中的任一条。本发明所提供的四重标签引物组中增加了平衡碱基序列,增加了文库多样性,提高了测序质量,在上机测序时仅需混合少量PhiX文库,并进行错位测序,减少了测序通量的浪费,保证了测序质量。
发明专利 CN201711212959.1
摘要:本发明公开了一种用于大肠癌诊断的尿液microRNA生物标志物、试剂盒及其应用。所述用于大肠癌诊断的microRNA生物标志物包含microRNA hsa‑miR‑92b‑5p、has‑miR‑4706、has‑miR‑3665、has‑miR‑3652、has‑miR‑3714和has‑miR‑550a‑3‑5p中的任意一种或两种以上的组合。所述试剂盒包括针对所述生物标志物中的部分或全部microRNA进行PCR检测所用的引物组及探针。本发明提供的生物标志物及相应引物组和探针可以用于制备诊断试剂盒,且其在应用于尿液样本的大肠癌诊断时,具有优异的灵敏度与特异性。
发明专利 CN201711206697.8
广州市锐博生物科技有限公司 广州锐康医学检验所有限公司 2017-11-27
摘要:本发明公开一种构建转录组测序文库的方法,包括以下步骤:提供包括含有待去除的rRNA的DNA分子;针对待去除的rRNA的DNA序列设计得到的Crispr RNA pool;使DNA样本与Crispr RNA pool、Crispr蛋白接触,获得Crispr系统编辑后的样本,得到转录组测序文库,以及构建转录组测序文库的试剂盒。本发明所述方式和试剂盒能够高效去除如rRNA等大量冗余RNA,富集样本中其他分子,提高了起始转录组测序的数据质量和有效数据比例,降低了测序成本。
发明专利 CN201711204585.9
摘要:本发明公开了用于构建猴子BCR文库的成套试剂与方法。本发明公开的构建猴子BCR文库的成套试剂为成套试剂A或成套试剂B;成套试剂A由成套试剂A1与成套试剂A2组成,成套试剂A1为序列表中序列1‑7所示的七条单链DNA,成套试剂A2为在序列表中序列8‑17的5′端均标记生物素的十条单链DNA;成套试剂B由成套试剂B1与成套试剂B2组成,成套试剂B1为序列表中序列18‑24所示的七条单链DNA,成套试剂B2为在序列表中序列25‑34的5′端均标记生物素的十条单链DNA。利用本发明的成套试剂构建的猴子BCR文库覆盖度高。
发明专利 CN201711190317.6
中国农业大学 北京市畜牧总站 2017-11-24
发明专利 CN201711182334.5
摘要:本申请属于基因工程技术领域,具体涉及一种快速捕获染色质短片段之间相互作用位点的方法的专利申请。该方法以HeLa S3细胞系为分析对象,包括细胞周期同步化培养、提取细胞核、制备测序文库、扩增测序文库、测序比对和分析定位等步骤。本申请中,借助于染色体构想捕获技术,可以较好发现特异性的染色质与染色质之间的相互作用片段,而这些特异性相互作用可为基因的表达调控分析奠定基础,同时对于染色质的三维结构分析奠定基础。总体而言,本申请对于方法的特异性却得到了较好验证。随着测序深度的增加,在分析染色质短片段与短片段相互作用方面相信会有更好的结果呈现。
发明专利 CN201711184718.0
摘要:本发明公开了一种转录组测序及RNAseq数据分析方法,①首先Total RNA(总RNA)→制备测序文库及测序④原始测序数据→各类统计学分析和功能注释;⑤不同个体原始测序数据→序列数据的质量评估(QC)各类统计学分析和功能注释。本发明采用临床样本对其进行定位定量的表达验证,寻找其与临床相关性的证据,评价临床价值,为肝癌发病学和肝癌机制研究提供新的线索。课题筛选的肝癌关键分子将为探索与早期发现、分类、评价预后相关的肝癌标志物,以及选择更加有效、准确的肝癌治疗靶位奠定研究基础。
发明专利 CN201711139327.7
摘要:本发明属于转录组分析领域,具体涉及一种单细胞mRNA逆转录与扩增方法。本发明能在5‑6小时内,由1‑2000个细胞或10pg‑20ng经提取的真核生物总RNA为起始,扩增出20‑500ng高质量全长双链cDNA。本发明可获得95%以上的逆转录与扩增成功率,扩增的全长cDNA可无缝衔接主流测序平台。本发明是在单细胞水平研究基因表达强有力的工具,极大地拓展了RNA‑Seq的应用范围,经本发明逆转录与扩增出的cDNA,可用作极微量样品的表达分析(单个细胞)、胚胎早期发育研究、肿瘤细胞异质性研究、免疫细胞群研究、干细胞分化研究。
发明专利 CN201711110244.5
摘要:本发明公开了一种微量降解基因组DNA甲基化建库测序方法,本发明通过测试不同建库技术,优化反应流程,建立了一种可以检测低至1ng严重降解基因组DNA的甲基化建库技术。通过测试不同酶组合,实现了降解DNA的末端修复、3端加A和DNA双链由于降解形成缺口的修复,在同一反应体系中完成;通过优化反应体系,实现在原反应液中连接测序接头;进一步测试接头生物素标记后,通过生物素和链霉素磁珠的特异性结合,实现后续亚硫酸盐处理前已连接接头基因组片段的钓取,减少目的片段的丢失;此外还优化建立亚硫酸盐反应体系和反应时间,降低处理过程中DNA的损伤,保证甲基化转换率,实现微量降解样本的甲基化建库和测序。
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