万方知识发现服务平台
排序:
范围:
发明专利 CN201710650277.2
摘要:本发明提供一种用于染色体异常检测的文库构建方法,通过对反应体系及反应条件的优化,实现了对羊水、脐血等少量样本的文库构建,缩短患者在临床染色体异常检测的等待时间。
发明专利 CN201710598345.5
摘要:本发明涉及一种蜕膜和绒毛配对cDNA芯片,所述的cDNA芯片通过如下方法制得:取孕早期流产妇女的蜕膜和绒毛组织,提取其RNA,逆转录成cDNA,预置在PCR反应板内,制作成cDNA芯片。本发明还提供该cDNA芯片的制备方法和应用。其优点表现在:每一位流产妇女分别取其蜕膜和绒毛组织cDNA形成配对,集中在同一芯片上,实现生理结构上的母‑胎界面在体外芯片上功能呈现。高通量,特异性强、敏感性高、操作简单快速、定量准确性高、结果可靠性强、结果分析简单并且样本带有完整的病例临床信息等优势,可用于定量检测目的基因在不同病人的表达情况及进行深入的临床信息相关性分析。
发明专利 CN201710589991.5
摘要:本发明公开了一种基于Crispr/cas9的捕获基因组目标序列的方法及其在高通量测序中的应用。本发明提供了一种基于Crispr/cas9系统从基因组DNA中捕获目标基因序列的方法:1)、根据目标基因序列设计合成多个gRNA;2)将用所述多个gRNA和所述cas9酶对所述基因组DNA进行切割反应,得到含有多个100‑300bp的片段化产物的切割产物;3)捕获所述切割产物中的目标基因序列的多个100‑300bp的片段化产物。本发明通过基于CRISPR基因编辑捕获靶序列,可用于高通量测序,适用于有家族遗传史的特定人群的筛查和大众体检市场等。
发明专利 CN201710552185.0
上海交通大学 2017-07-07
摘要:本发明提供了一种定量高通量测序文库的制备方法及其配套试剂盒,具体地,本发明提供了一种衔接子,所述衔接子具有式I或II所示的结构:各式中,S1为任选地引导部(N)m,N为A、T、G、C中任一碱基,m为1‑150的正整数;pS1为磷酸化的S1;S2为茎部1,具有SEQ ID NO.:1所示的核苷酸序列;S3为环部,其中含有至少一个碱基U;S4为茎部2,具有SEQ ID NO.:2所示的核苷酸序列;S2与S4完全互补或部分互补;S5为无或与引导部S1互补的延伸部;S6为无或含有至少一个碱基T的结合部;若S5为无,则S6为无;“─”为化学键。5'‑S1─S2─S3─S4─S5─S6‑3'   (I)5'‑pS1─S2─S3─S4─S5─S6‑3'   (II)。
发明专利 CN201710552555.0
清华大学 2017-07-07
摘要:本发明提出了一种构建待测基因组的DNA测序文库的方法,该方法包括:(1)利用限制性内切酶对待测基因组进行消化处理,以便获得消化处理产物;(2)将所述消化处理产物进行生物素标记处理,以便获得生物素标记处理产物;(3)利用DNA连接酶对所述生物素标记处理产物进行连接处理,以便获得连接产物;(4)将连接产物进行解交联处理;(5)将解交联处理产物进行纯化处理;(6)将纯化处理产物进行超声和沉淀处理,所述沉淀处理是通过将超声处理产物与链酶亲合素磁珠进行接触进行的,以便获得结合有链酶亲合素磁珠的目标DNA片段;以及(7)基于结合有链酶亲合素磁珠的目标DNA片段,进行建库。
发明专利 CN201710482291.6
摘要:本发明属于生物技术领域,具体涉及一种人类多基因突变检测试剂盒(高通量测序法)及其用途。所述试剂盒中包括KRAS基因突变检测引物对、EGFR基因突变检测引物对和ALK基因融合检测引物对。本发明的试剂盒能够同时检测DNA突变和RNA融合,灵敏度高,检测限低,特异性高,重复性好,准确率及阳性符合率均高达100%。
发明专利 CN201710476884.1
摘要:本发明公开了一种用于检测染色体拷贝数变异的测序文库的构建方法,其主要包括以下步骤:(1)利用双链DNA片段化酶将待测DNA随机片段化;(2)对片段化后的DNA进行末端补平和3’端悬A;(3)将末端补平并3’端悬A的DNA与测序接头连接,获得连接产物;(4)纯化所述连接产物,获得测序文库,其中步骤(1)‑(3)在单一反应管中完成。本发明还提供用于构建检测染色体拷贝数变异的测序文库的试剂盒。
发明专利 CN201710463397.1
东北农业大学 2017-06-19
摘要:一种通过酶切基因组构建CRISPR/Cas9基因组敲除文库的方法,涉及一种基因组敲除文库的构建方法。是要解决现有敲除文库构建方法存在物种基因信息不完善、人工设计覆盖度低且耗时耗力的问题。方法:一、构建Mspl.f‑library文库;二、获得20bp gRNA靶序列片段;三、构建PAM‑f.library文库;四、Lenti‑gRNA‑library文库构建。本发明获得gRNA文库的方法不依赖于已知物种基因组序列信息,避免了物种基因信息不完善、人工设计覆盖度低且耗时耗力等缺点,大大提高敲除文库的覆盖率。本发明用于构建CRISPR/Cas9基因组敲除文库。
发明专利 CN201710442531.X
扬州大学 2017-06-13
摘要:本发明属于生物技术领域,具体涉及一种特异识别栽培稻第9号染色体整条短臂的寡核苷酸文库及识别的方法。所述寡核苷酸文库,由SEQ ID NO.1‑2258所示的共2258条寡核苷酸组成。本发明还开了特异识别栽培稻第9号染色体整条短臂的方法,是先用所述的特异寡核苷酸文库制备获得带有荧光标记的特异寡核苷酸探针共2258个,再利用这些探针进行荧光原位杂交,根据荧光信号识别栽培稻第9号染色体整条短臂。利用本发明的整条染色体臂的涂染探针,可以识别水稻第9号染色体整条短臂,可以用其分析和研究染色体的重组、畸变和同源基因,也可以研究不同物种来源的染色体之间的进化关系。
发明专利 CN201710403824.7
上海长海医院 2017-06-01
摘要:本发明公开了一种前列腺癌早期诊断和预后判断的标志物长链非编码RNA lncLOX5‑1及其应用。本发明还公开了所述lncLOX5‑1在预测前列腺癌患者肿瘤恶性程度中的应用,在预测前列腺癌患者肿瘤是否进展转移中的应用,在预测拟行前列腺穿刺的患者的阳性率中的应用等。将lncLOX5‑1用于前列腺癌的早期诊断和预后判断,具有高准确度、高特异性和高灵敏度的特点。
发明专利 CN201710389217.X
摘要:本发明公开了一种基于DNA的融合基因定量测序建库方法,步骤包括:1)构建基因组片段化DNA文库并纯化;2)PCR扩增捕获融合基因发生区域,并纯化、富集包含引物特异片段的序列;3)巢式PCR扩增捕获包含融合基因的目的片段;4)构建用于高通量测序的DNA测序文库。本发明还公开了用上述方法制备的DNA测序文库进行融合基因定量测序检测的方法、该方法的用途,以及包含该DNA测序文库的检测试剂盒。本发明使用单向特异引物锚定融合断点发生的下游,通过特异和通用引物配对,运用PCR方法获取目的序列,再运用标签富集和巢式PCR进一步降低背景,如此提高了特异性,减少了建库时间和成本,适合用于FFPE样本或液态活检。
发明专利 CN201710382858.2
摘要:本发明涉及一种用于扩增子文库扩增和富集时使用的多重上游发卡结构引物及使用所述多重上游发卡结构引物提高基因低频突变检测灵敏度的扩增子文库构建方法,所述引物从3’端至5’端包括:与目标区域序列互补配对的特异性序列A1;发卡结构的稳定序列A2;与5’端A7序列的反向互补序列A3;发卡结构的去稳定序列A4;条码序列A5;接头序列A6;5’端序列A7;A3和A7互补配对,形成所述多重上游发卡结构引物的茎结构;A4、A5和A6形成所述多重上游发卡结构引物的环部分。
发明专利 CN201710382859.7
摘要:本发明提供了一种利用Cas9/gRNA系统构建扩增子文库的方法。该构建方法包括以下步骤:S1,使用多重PCR技术扩增多个目标区域,得到扩增子;S2,采用Cas9/gRNA系统特异性切除所有扩增子和引物二聚体两侧的通用序列,去除引物二聚体;S3,对扩增子的5’端进行磷酸化修饰,3’端添加“A”,采用连接酶将测序接头分别连接到扩增子的5’端和3’端,磁珠纯化后得到扩增子文库。使用Cas9/gRNA系统消化第1轮反应后的扩增子,能有效去除第1轮反应过程中产生的引物二聚体,提高文库的纯度,增强测序信号的信噪比,同时还可以提高测序数据的均一性,降低文库测序的数据量,降低扩增子文库构建的成本。
发明专利 CN201710349685.4
摘要:本发明公开了一种癫痫脑病基因芯片,所述基因芯片包括针对如下基因的探针:ABCC8、NOTCH3、SCN1A、GCK、TSC2、GALNS、NPC1、MECP2、NF1。在一个实施方案中,所述探针的序列为SEQ ID NO.1‑79。本发明是基因芯片可以实现对癫痫脑病的基因检测。
发明专利 CN201710339037.0
摘要:本发明公开了一种肿瘤放射治疗毒性基因突变文库的构建方法,其特征在于:覆盖人类肿瘤放射治疗毒性相关42个基因上总共61种遗传性变异位点。本发明的构建方法针对多个靶序列进行单管,快速完成文库的构建,整个文库构建过程仅需要2~3小时,手动时间仅仅需要45分钟即可,可以十分有效的解决目前对于临床上患者接受肿瘤放射治疗前预测是否会发生较大毒副作用,而需要对多基因、多靶点检测这一难点,且成本低廉。
发明专利 CN201710339781.0
摘要:本发明公开了一种肿瘤治疗心脏毒性预测基因突变检测文库的构建方法,其特征在于:覆盖人类肿瘤治疗心脏毒性相关38个基因上总共56种遗传性变异位点。本发明的构建方法针对多个靶序列进行单管,快速完成文库的构建,整个文库构建过程仅需要2~3小时,手动时间仅仅需要45分钟即可,可以十分有效的解决目前对于临床上患者接受肿瘤药物治疗前预测是否会发生较大心脏毒性,而需要对体细胞多基因、多靶点检测这一难点,且成本低廉。
发明专利 CN201710319361.6
古博 2017-05-09
摘要:本发明公开了增强子筛选高通量测序文库简易构建的载体制作方法,包括以下步骤:步骤一,构建含有SpeI单酶切位点和EcoRI酶切位点质粒1;步骤二,使用多重PCR扩增待测增强子群;步骤三,连接高通量测序接头序列1和2,使用引物1和引物2进行PCR扩增,构建含有待测增强子的DNA文库1;步骤四,使用引物3和引物4,PCR扩增DNA文库1,得到DNA文库2;步骤五,使用SpeI和EcoRI双酶切质粒1和DNA文库2,酶联两者的双酶切产物,构建成结构含有多个待测增强子的质粒群2;本发明的设计使得对其所含待测增强子的转录本RNA进行高通量测序文库构建的步骤由常规步骤变成了引物2反转录和PCR两步。此外,使用引物2反转录,避免了oligo dT反转录过程中将大量无关的mRNA转录,降低了后续测序成本和数据分析难度。
发明专利 CN201710300189.X
摘要:本发明公开了一种用于胃腺癌诊断的生物标志物,所述生物标志物为LINC01234。LINC01234在胃腺癌患者中表达水平显著上调,TCGA数据库交叉验证了这种差异表达;对LINC01234进行ROC曲线分析,发现LINC01234具有较高的AUC值,以及较高的准确性和特异性,提示LINC01234可作为潜在的标记物应用于胃腺癌的早期诊断。
发明专利 CN201710301856.6
徐州工程学院 2017-05-02
摘要:本发明公开了一种检测食源性致病菌生物芯片的制备方法,属于食源性致病微生物检测技术领域,本发明以食源性致病菌独有的蛋白基因序列设计其特异性的CP、DP和RCP。CP和DP含有与待检菌基因组DNA特异性序列互补的序列,RCP不含任何待检菌基因组DNA序列;CP点样固定在醛基修饰的芯片表面,制备成捕获探针微阵列,在片CP和DP与待检菌基因组DNA退火并连接,加入链亲和素与固相RCA扩增产物结合,在一定的条件下洗脱。用近红外荧光成像仪扫描芯片,检测CP与DP能否连接,以及能否实现滚环扩增和检测靶标,从而特异性检测目标食源性致病菌。该方法可检测多种食源致病性微生物,适用于食品、养殖及口岸等多种食源致病性微生物高通量、快速、准确检测。
发明专利 CN201710288214.7
摘要:本发明公开了一种用于检测副猪嗜血杆菌的基因芯片的制备及使用方法,包括以下步骤:(1)设计特异性引物和探针:以副猪嗜血杆菌的infB基因序列为靶序列,设计特异性引物和探针,副猪嗜血杆菌上游引物基因序列如序列表中SEQ ID NO:1所示,副猪嗜血杆菌下游引物基因序列如序列表中SEQ ID NO:2所示,所述的探针基因序列如序列表中SEQ ID NO:3所示;(2)合成上述特异性引物和探针;(3)基因芯片的制备:用TE Buffer溶解合成探针,在醛基化基片上接触式点样,点样完毕后将基因芯片干燥。本发明操作简便易行,省去了已点样基因芯片的水化处理和预杂交步骤,杂交只需2h,大大节省了时间,达到了快速检测的目的,可用于大规模检测。
万方书案
学术圈
足迹
订阅