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摘要:旨在探讨低深度测序在检测单细胞染色体微小变异中的应用。以经过比较基因组杂交(arrayCGH,aCGH)检测的5例阳性细胞系为研究对象,从中分离的单细胞分别用两种单细胞扩增试剂盒进行扩增,采用Hiseq2000测序平台进行全基因组测序,然后进行生物信息学分析,将检测结果与已被 aCGH 证实的结果进行比较。结果显示,5个单细胞的全基因组扩增成功,通过低深度测序均获得明确的检测结果。在用 GenomePlex?SingleCellWGAKit 试剂盒的处理中检出区域与 aCGH 检测区域均有80%以上的重叠,1个样本检出了8Mb(Megabase)左右的假阳性;在用 PicoPLEX?WGAKit 试剂盒处理时检出信号与 aCGH 区域也有80%以上的重叠且无假阳性信号产生。证实在数据量为0.1X 左右时可以检出单细胞染色体上7Mb 以上的拷贝数变异。...
摘要:在全球变暖的背景下,冰川泥石流将进入高发期.分析了冰川泥石流成因,选取日最高温度、日降雨量、泥水位、地表位移、含水率作为泥石流监测预警指标.通过层次分析法确定了5个指标的权重,提出了基于激发条件和堆积体稳定性的冰川降雨型泥石流预警模型.应用该模型成功对天山公路K636冰川泥石流沟2017年7月14日爆发的泥石流进行了预警,证明该预警模型有一定的可靠性和实用价值,为冰川泥石流预警研究提供了一种新的参考....
[博士论文] 陈芳
细胞生物学 中国科学院大学 2018(学位年度)
摘要:脂滴(Lipid droplets,LDs)是由单层磷脂包裹着中性脂内核形成的具有特殊结构的细胞器,普遍存在于真核生物细胞中。其在脂质代谢网络中处于中心地位,发挥着为细胞提供能量和生物膜合成底物等多种功能。同时,脂滴与人类健康息息相关。脂滴的形成和代谢异常与肥胖、脂肪肝、脂代谢障碍疾病等有着密切的关联。在哺乳动物细胞内,脂滴从内质网上由中性脂逐渐聚集形成。但是其发生过程及分子机制目前还非常不清楚。脂滴在内质网上形成的模型也有待验证和完善。已知定位在内质网上的蛋白Fitm2、Seipin等参与脂滴在内质网上形成的过程,但是具体机制尚不清楚。
  我们以线虫为模式生物进行遗传筛选,得到了fitm-2的突变体。该突变体的内质网形态和脂滴表型均发生改变,即片状内质网增多,脂滴变少变小。在哺乳动物细胞内的进一步研究发现,管状内质网塑形蛋白如Rtn4、Reep5、Reep1与Fitm2间存在相互作用,它们的相互作用发生在跨膜区。当细胞内缺失管状内质网塑形蛋白时,脂滴表型发生和Fitm2敲除类似的改变,脂滴变少变小。在油酸(OA)诱导新脂滴产生的过程中,Fitm2和管状内质网塑形蛋白间的相互作用增强。同时,管状内质网塑形蛋白的缺失,使新脂滴产生的过程受到抑制。某些管状内质网塑形蛋白如Rtn4、Reep1与Seipin间也存在相互作用,Rtn4或Reep1的缺失能够增强Fitm2和Seipin的相互作用。我们的结果表明,管状内质网塑形蛋白通过与Fitm2的相互作用,参与并促进Fitm2介导的脂滴形成过程。此外,Fitm2功能的缺失也会改变内质网形态,使片状内质网增多。
[期刊论文] 马瑞芳 陈芳 祝幼华 周洋
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CSTPCD 北大核心
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摘要:文中研究台湾海峡中北部大陆架区表层沉积的近代沟鞭藻囊孢组合特征及其与海区环境的关系.沟鞭藻囊孢组合由膝沟藻类和多甲藻类的12属19种和裸沟藻类的一个未定囊孢属种组成,还包含丰富或较丰富的微体有孔L虫壳体内膜.该组合代表一种适应温暖内浅海环境的沟鞭藻生物群落.文中还对首次在我国发表的沟鞭藻囊孢种进行了描述....
[博后论文] 陈芳
力学;应用数学和力学 中国科学院;中国科学院大学;中国科学院力学研究所 2013(学位年度)
摘要:本文主要研究了Adomian分解法和修正的埃尔米特与反埃尔米特分裂(MHSS)迭代法.很多实际问题可以通过建立模型而用微分方程来表示.微分方程的解可以通过分析解和数值解来表达.一般来讲,分析解可以对问题本身有更好的解释,但是很难得到.另一方面,可以通过对微分方程进行有限元或差分离散得到代数方程组,从而求得问题的数值解.
  在二十世纪八十年代,人们提出了作为求解微分方程分析解的Adomian分解法.Adomian分解法通过无穷序列的形式给出了精确解或近似解.根据Adomian分解、多步Adomian分解法和近似Adomian分解法,给出了修正的近似Adomian分解法、多步渐进Adomian分解法和多步修正的渐进Adomian分解法.通过简化非线性项,修正的近似Adomian分解法和多步修正的渐进Adomian分解法给出了更易计算的Adomian多项式表达式.用修正的渐进Adomian分解法去求解描述地下水流的非线性Boussinesq方程,也用修正的渐进Adomian分解法、多步渐进Adomian分解法和多步修正的渐进Adomian分解法去求解一些非线性微分方程.这些例子说明了上述三种方法的有效性.另一方面,把Padé逼近和Laplace变换作为后处理技术与Adomian方法结合起来,求出了描述HIV传染模型的近似解.数值算例说明了后处理技术的有效性.
  MHSS迭代方法是于2010年提出的求解线性代数方程组的一种有效的数值方法.本文中讨论了MHSS迭代法用于求解一类复对称奇异线性方程组的半收敛性质.建立了关于MHSS迭代法的半收敛定理,并给出了MHSS迭代法的半收敛因子的上界.数值例子证实了MHSS迭代法无论作为解法器还是作为预处理子都是有效的.基于MHSS迭代法,构造了预处理MHSS(PMHSS)迭代法,并运用PMHSS迭代法去求解和预处理一类由Galerkin有限元离散一类分布式控制问题所产生的分块二阶线性方程组.建立了这类PMHSS迭代法的收敛理论,并给出了PMHSS预处理矩阵的谱的分布.通过使用PMHSS预处理子去预处理Krylov子空间迭代法,比如GMRES方法,验证了PMHSS的预处理子的有效性.
[硕士论文] 陈芳
科学技术哲学 中国科学院大学;中国科学院研究生院 2010(学位年度)
摘要:由少年儿童出版社于上世纪50年代末酝酿、60年代前半期推出并完善的《十万个为什么》(以下简称《十万》),自初版以来多次重印、再版,对于那些生活在改革开放前,物质条件与文化生活相对贫匮、意识形态色彩浓厚的社会环境中的广大青少年以及普通公众,产生了难以估量的影响。本研究全面梳理了从建国筹备至文革前的有关背景,特别是特殊年代中社会环境与政治思潮影响下中国科普事业发展的状况;在调研所获资料与文本分析的基础上探讨了《十万》出版计划的因缘与结果,包括它所遭遇的困难与挑战,选题、写作、加工、审阅、出版与推向社会的过程;由此分析其社会影响,揭示其获得成功的原因,从而为我们顺应时代发展建立自己的科普品牌提供借鉴。本研究的主要创新点在于:(1)在对史料深度挖掘与口头调研的基础上,完整重构了《十万》的编辑本末:(2)首次对《十万》的不同版本及在不同年份的发行情况进行了系统的梳理;(3)从科普史、出版史与科学传播学的角度对这一影响巨大的作品进行研究,揭示其对于今人营造中国自己的科普品牌的示范意义。
[硕士论文] 陈芳
计算机应用技术 中国科学院大学;中国科学院研究生院 2008(学位年度)
摘要:随着GNSS(全球导航卫星系统)的发展和广泛应用,利用GNSS信号作为照明源进行海洋遥感是当前GNSS应用的新领域,已经受到国内外很多学者的关注。本文研究了基于GNSS信号被动雷达的定位问题,主要工作如下:
  1、完整的提出了一套基于GNSS信号被动雷达的定位思路,研究了可能的观测量,推导出两种定位解算方法。指出:基于多星伪距测量的方法在单目标下可用并且定位精度高,在多目标的情况下会出现目标纠缠问题;而基于单星伪距加多普勒的方法避免了多目标纠缠问题,更加实用。
  2、对单星伪距加多普勒方法的精度进行了细致的仿真分析,结果表明这种定位方法能达到百米级的二维定位精度.
  本文的研究成果表明了基于GNSS信号被动雷达的可行性,对利用GNSS作为照射源这项遥感技术的发展具有参考意义。
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