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摘要:为探究MYOD1和AKT3基因启动子区的多态性及其可能存在的影响基因表达的分子调控机制,试验采用PCR直接测序的方法对大白猪MYOD1和AKT3基因启动子区的多态性进行检测,同时利用生物信息学分析方法预测了大白猪MYOD1和AKT3基因的核心启动子区、CpG岛和转录因子结合域.结果 显示,MYOD1基因共预测到5个核心启动子区、1个CpG岛区域和10个转录因子结合域,且第5个核心启动子区位于CpG岛区域内;AKT3基因共预测到6个核心启动子区,未发现CpG岛的存在.通过直接测序的方法检测到MYOD1基因在G-361T处存在1个SNP突变,但在本试验群体中只发现1种基因型,同时该突变位点位于第1个核心启动子区内;AKT3基因在启动子区T-1709C处存在1个SNP突变,包括TT、TC和CC 3种基因型,其中TT基因型为优势基因型,T为优势等位基因.遗传多态性分析提示,该突变位点多态信息含量(PIC)介于0.25~0.5之间,表现为中度多态.本研究初步探究了大白猪MYOD1和AKT3基因启动子区的多态性并预测了启动子区可能的调控因子和调控元件,为进一步研究MYOD1、AKT3基因对肌肉生长发育的调控机制及将突变位点作为遗传标记用于分子选育提供指导和依据....
摘要:试验旨在利用CRISPR/Cas9技术分别在鸡成纤维细胞DF-1和鸡胚胎干细胞(Embryomic stem cell,ESCs)上介导CPED1基因敲除,以期为后续研究CPED1基因功能提供技术依据.克隆CPED1基因全长;构建cas9/gRNA载体并转染DF-1和ESCs,经流式分选阳性细胞,采用T7E1酶切法选择活性最佳的敲除载体并分析其敲除效率;同时,对DF-1中的脱靶效率进行检测.结果成功克隆鸡CPED1基因,并构建3个cas9/gRNA载体;T7E1酶切结果表明cas9/gRNA1载体在DF-1阳性细胞中的敲除活性(37%)最佳,该载体也可定点敲除ESCs中的CPED1基因,敲除活性为25%,且在DF-1细胞中未发生脱靶.表明CRISPR/Cas9可有效介导鸡CPED1基因在DF-1和ESCs上敲除....
摘要:[目的]探究蛋白质代谢在鸡雄性生殖细胞分化过程中的作用机制,为完善鸡胚胎干细胞(embryonic stem cell,ESC)体外向雄性生殖细胞诱导分化体系研究提供依据.[方法]采用流式分选的方法获取高纯度的ESC、原始生殖细胞(primordial germ cells,PGCs)和精原干细胞(spermatogonia stem cell,SSCs),分别提取细胞的总RNA,采用RNA-Seq方法对3种细胞的转录本进行深度测序,然后进行WEGO (web gene ontology)和KEGG (kyoto encyclopedia of genes and genomes)通路富集分析,筛选出鸡雄性生殖细胞分化过程中参蛋白质代谢的关键通路及其关键基因,RT-qPCR (Real time Quantitative PCR)检测部分关键差异基因的表达变化,并RNA-Seq (RNA sequencing)结果进行比较分析,同时分别从体内和体外水平对关键基因NOS2进行抑制,观察各分组不同天数的细胞形态变化及检测NOS2和C-kit、Cvh、Stra8,Dazl、integrin α6和integrin β1等生殖标记基因表达变化情况.[结果]在雄性生殖细胞分化的整个阶段,有697个差异基因参生物代谢,显著富集于精氨酸-脯氨酸代谢通路、酪氨酸代谢通路以及色氨酸代谢通路,在这3条通路上筛选出NOS2、FAH和IDO等关键性基因,这些基因的在ESCs向SSCs分化过程中表达变化趋势其在RNA-Seq中的结果一致.体内抑制NOS2基因后,NOS2及C-kit、Cvh、Stra8、azl、integrinα 6和integrin β1等生殖标记基因在空白组和对照组之间无显著性的差异,而在抑制剂组中,NOS2及C-kit、Cvh、Stra8、Daz1、integrinα6和in tegrinβ1等生殖标记基因的mRNA表达量均出现了降低;而体外抑制NOS2基因后,对照组中的ESCs在2、4、6、8和10d内细胞不断增殖,但是未出现类胚体;RA诱导组中,2d出现小的类胚体,4d类胚体增大,且数量增多,6d类胚体边开始出现破裂,8d类胚体解体,10d出现类精原样细胞;抑制剂组中,ESCs在2、4、6、8和10d内无类胚体出现,且相较于对照组细胞增殖缓慢;RA+抑制剂组中,2和4d内无类胚体出现,细胞增殖缓慢,6d出现小的类胚体,8d类胚体数量少量增多,且体积稍显增大,10d类胚体开始裂解.并且经过抑制剂的掷制后,NOS2及C-kit、Cyh、Stra8、Dazl、integrin α6和integrin β1等生殖标记基因的表达量在RA诱导组、抑制剂组和RA+抑制剂组中相对于对照组均呈显著性或极显著性的下调趋势.[结论]基于RNA-Seq技术及生物信息学方法筛选出ESCs向雄性生殖细胞分化过程中精氨酸-脯氨酸代谢通路及关键基因NOS2的基础上,通过对NOS2基因在鸡体内和体外的抑制,发现NOS2在被抑制后,ESCs向雄性生殖细胞分化的过程受到抑制.说明了精氨酸-脯氨酸代谢通路及关键基因NOS2对ESCs向雄性生殖细胞分化过程中起到重要的调节作用....
摘要:本研究旨在家鸡上建立一种高效、稳定的基因组定点编辑技术体系,实现目的基因定点敲除,为后续家鸡基因编辑提供操作依据.基于NCBI数据库提供的CDS序列克隆C2EIP (chr2,Expression In PGC)基因全长,并根据基因序列中APM的位置设计特异性gRNA1、gRNA2和gRNA3,并构建cas9/gRNA载体;将设计好的cas9/gRNA转染状态良好的DF-1,利用Luciferase SSA重组检测法、T7E1酶切法以及TA克隆测序法检测gRNA在DF-1细胞中基因的敲除效率.Luciferase SSA重组检测结果表明,只有cas9/gRNA3载体具有基因敲除活性,荧光活性比对照组高两倍,T7E1酶切结果显示cas9/gRNA3基因的敲除活性为27%,TA克隆测序结果表明,30个测序菌液中有8个菌液出现不同数目的碱基缺失或增加,初步估计基因敲除效率为26%.通过本研究在家鸡中初步建立了cas9介导的基因敲除技术,该技术能够稳定的在鸡的细胞DF-1上介导基因敲除....
摘要:旨在确定小鼠DAZL启动子基本活性区,并分析启动子区域甲基化对其启动子活性的影响,探究小鼠DAZL的表达调控机制.采用PCR法扩增不同长度的小鼠DAZL启动子,插入到pEGFP-N1和pGL3-Basic载体,构建重组载体.将重组载体转染GC-1细胞系,并通过添加适量DNA甲基化转移酶抑制剂(5-azacytidine,5-aza-C)逆转各试验组启动子片段的甲基化水平,然后利用双荧光素酶报告基因检测系统检测DAZL活性变化.双荧光素酶活性检测结果表明,小鼠Dazl启动子基本活性区域为5’侧翼区-370 ~-36 bp,在-370 ~-166bp区域存在不可或缺的重要调控元件;经5-aza-C处理后,各缺失片段载体转染的GC-1细胞DAZL的启动子活性对照组相比均有不同程度的提升,但差异不显著.本试验确定了小鼠DAZL启动子基本活性区域,证明降低小鼠睾丸DAZL启动子区域甲基化水平,有助于DAZL在生殖细胞中特异性表达,为进一步探究DAZL生物学功能和调控机制提供参考....
摘要:【目的】探索家鸡雄性生殖细胞分化过程中脂代谢相关基因以及信号通路的调控机制,以期为完善体外诱导体系提供依据。【方法】采用流式细胞分选法获得纯度较高的胚胎干细胞(embryonic stem cell,ESC)、原始生殖细胞(primitive germ cells,PGC)和精原干细胞(spermatogonial stem cell,SSC),提取细胞总RNA。利用RNA-seq高通量分析方法对这三种细胞进行转录组水平测序,进行GO(Gene ontology)分析和KEGG通路富集,寻找脂代谢相关基因以及信号通路;并利用脂代谢--视黄醇代谢通路终产物视黄酸(retinoic acid,RA)以及抑制剂苯磺酰异羟肟酸(piloty’s acid)在体外诱导ESC向雄性生殖细胞分化和体外鸡胚注射后孵化,qRT-PCR (quantitative real time PCR)检测视黄醇代谢通路上差异基因的表达变化,RNA-seq结果进行比较分析同时检测雄性生殖细胞标记基因的变化情况。【结果】GO功能显著性富集和 Pathway 显著性富集分析结果发现:在ESC向SSC分化过程中共存在328个基因持续参脂代谢调控,富集到27条脂代谢通路中,包括视黄醇代谢、初级胆汁酸的合成、甾类激素的生物合成、脂肪酸代谢、甘油酯代谢以及类固醇的生物合成等通路。在视黄醇代谢通路中ADH5在PGC中特异表达,ALDH1A1在整个发育过程中持续上调,ADH5和ALDH1A1在细胞中参视黄酸的合成;CYP26b1在整个发育过程中持续上调,参视黄酸的降解过程;RA体外诱导ESC向SSC方向诱导试验结果表明ADH5、ALDH1A1和CYP26b1家族基因在体外RA诱导过程中变化体内分化过程一致,RA诱导组产生的SSC样细胞显著高于控制组和Piloty’s Acid+RA组。鸡胚注射抑制剂试验结果表明视黄醇通路被抑制后孵化至18d后SSC细胞表面特异标记基因integrinα6和integrinβ1的表达水平显著的低于正常的孵化组(CON)和阴性对照组(BLANK)【结论】脂代谢--视黄醇代谢通路在家鸡雄性生殖细胞的分化过程中起重要作用,体外利用视黄醇代谢通路终产物RA进行诱导时第2天出现类胚体,第4、6天类胚体逐渐增大,第8天开始裂解,在第10天出现SSC样细胞,而在诱导过程中抑制视黄醇通路信号后则会降低SSC样细胞的产生,而在体外孵化过程中视黄醇通路抑制后也能影响SSC细胞的产生。...
摘要:本研究旨在通过悬浮培养法培养鸡胚胎干细胞(Embryonic stem cells,ESCs),摸索鸡胚胎干细胞形成类胚体(Embryoid body,EB)的最佳方案,以期提高鸡胚胎干细胞体外诱导效率.将鸡ESCs培养传代至第3代,采用1×104、3×104和6×104 mL-13个细胞浓度,使用悬滴培养后,观察类胚体的形成效率.对悬滴培养形成的类胚体进行形态学观察,qRT-PCR检测干细胞标记基因的表达,免疫细胞化学检测相关蛋白的表达,并进行类胚体自分化检测和核型分析.3×104 mL-1细胞浓度生成的类胚体数量最高,单个视野下可观察到约267个类胚体,且形成的类胚体大小均一,呈圆球状.qRT-PCR检测结果表明,在类胚体形成48 h内,干细胞标记基因Nanog、Sox2、Oct4和C-kit仍维持表达.免疫细胞化学检测显示,该方法形成的类胚体表面抗原检测Nanog和SSEA-1呈阳性.自分化检测三胚层分化标记基因SOX17、SMA和TUJ-1呈阳性.核型分析显示,悬滴培养形成的类胚体具有并保持正常的核型.鸡ESCs悬滴培养形成类胚体的适宜细胞浓度为3×104 mL-1,且形成的类胚体可分化成3个胚层,用于体外定向诱导过程.本研究建立了鸡ESCs体外悬滴培养形成类胚体的培养体系,为后期信号通路的体外验证提供试验基础....
摘要:高邮鸭又称高邮麻鸭,是江苏省里下河地区经长期选育而成的一种大型蛋肉兼用麻鸭,是我国优秀的水禽品种资源.高邮鸭因蛋肉品质优异、善产双黄蛋而驰名中外,以独特的适应性和品质优良而备受欢迎[1].高邮鸭经过多年选育,体型外貌一致,生产性能、肉用性能、繁殖性能稳定,育种指标稳中有升,种群规模不断扩大,高邮鸭的饲养量逐年上升[2].高邮鸭肉质鲜美,营养丰富,可作为培育肉用鸭的原始制料,但目前关于高邮鸭的研究主要集中在蛋用型、营养学及遗传育种等方面,对高邮鸭肉用性能方面的研究较少....
摘要:[目的]本研究旨在家鸡上建立一种高效、稳定的基因组定点编辑技术体系,实现目基因的定点敲除,为后续家鸡基因编辑提供操作依据。[方法]基于NCBI 数据库提供的CDS 序列克隆C2EIP(chr2,Expression In PGC,C2EIP)基因全长,并根据基因序列中APM 的位置设计特异性gRNA1,gRNA2 和gRNA3 并构建cas9/gRNA 载体;将设计好的cas9/gRNA 转染状态良好的DF-1,利用luciferase SSA 重组检测法、T7E1 酶切法以及TA 克隆测序法检测gRNA 在DF-1 细胞中基因的敲除效率。
摘要:[目的]确定苏秦黄鸡Stra8 基因启动子的主要调控区域和预测调控元件的结合位点,探索用他米巴洛丁(Am80)或曲古抑菌素(TSA)诱导对Stra8 启动子活性的调控作用。[方法]将苏秦黄鸡Stra8 基因5'侧翼系列缺失片段插入到pGL3-basic 载体构建重组质粒并转染DF-1 和GC-1 细胞,通过检测双荧光素酶活性和预测启动子区域调控元件的结合位点,选取适宜的启动子片段并构建其重组质粒Stra8-EGFP;将Am 80 和TSA 分别按一定的浓度梯度诱导经转染细胞,进行荧光素酶活性检测以筛选Am 80 和TSA 的最佳诱导浓度;用最适剂量的Am 80 和TSA 分别单独或联合诱导转染重组质粒Stra8-EGFP 的DF-1 细胞,通过观察绿色荧光表达程度检测Am 80 和TSA 在细胞水平对Stra8 启动活性的影响;选取生长至第三代的ESCs,培养基中添加最适浓度的Am 80 和TSA,每隔2 天观察细胞分析其对ESCs 体外分化的影响,并对诱导至第十天的细胞进行间接免疫荧光检测和荧光定量诱导不同天数生殖标记基因的变化。[结果]双荧光素酶活性检测结果显示,鸡Stra8基因启动子区-1055~+54 片段的活性较强,且含有RARα、RXRα和RARβ的结合位点;使用不同浓度的Am80 和TSA 对其进行诱导后发现二者分别在浓度为10-5mol/L 和10-6mol/L 时相对荧光素酶活性值最高,说明此浓度是Am80 和TSA 最佳诱导浓度;分别采用Am 80 和TSA 单独或联合对转染的细胞进行诱导后发现,Am 80 和TSA 协同作用的荧光素酶活性最高;重组质粒Stra8-EGFP转染DF-1 细胞后,用最佳浓度的Am 80 和TSA 联合诱导可见最强绿色荧光程度;诱导至第10 天的细胞能够表达integrinβ1 蛋白,表明Am80 和TSA 可促进ESCs 向SSCs 分化。对诱导不同天数的细胞进行生殖特异标记基因检测,结果表明Am80 和TSA 能够促进ESCs 向PGCs 和SSCs 样细胞分化,二者联合诱导组SSCs 样细胞生成效率显著高于对照组或单独诱导组。[结论]成功分析了鸡Stra8 基因启动子的活性和调控元件的结合位点,确定Am 80 和TSA 联合诱导可显著提高Stra8基因启动活性,促进ESCs 向PGCs 和SSsC 样细胞分化。该结果为通过提高Stra8 的表达量而促进雄性生殖细胞生成的效率提供参考依据。
摘要:前言生殖细胞在有性繁殖的生物中肩负着将遗传信息在世代中传递的任务,并能代替胚胎干细胞(ESCs)用于治疗和遗传修饰,而不涉及伦理和免疫排斥问题。但是,如何在体外培养条件下获得大量的精原干细胞(SSCs)并使其能够产生具有功能性的精子就显得尤为迫切和必要。尽管关于ESCs分化为雄性生殖细胞的研究取得了令人振奋的研究进展,但是由于各个研究组所用的诱导方案迥异,尚没有一个稳定有效的诱导体系且诱导效率较低;受取材和干细胞RNA量少的限制,几乎还没有研究组开展数字基因表达谱(RNA-Seq)研究,揭示参生殖细胞分化的关键基因和信号通路,以及这些关键基因的被调控模式及其阐明其是如何影响生殖细胞分化的启动和减数分裂的起始,只有系统地解决这些问题,才能高效、稳定地将ESCs诱导为雄性生殖细胞,克服体外诱导的不确定性。
摘要:[目的]探索家鸡雄性生殖细胞分化过程中脂代谢相关基因以及信号通路的调控机制,以期为完善体外诱导体系提供依据.[方法]采用流式细胞分选法获得纯度较高的胚胎干细胞(embryonicstem cell,ESC)、原始生殖细胞(primitive germ cells,PGC)和精原干细胞(spermatogonial stem cell,SSC),提取细胞总RNA.
摘要:[目的]本研究旨在探寻参调控鸡雄性性原细胞分化的关键基因和信号通路,以期提高雄性生殖细胞的体外诱导生成效率。[方法]采用流式细胞分选法获得纯化的鸡胚胎干细胞(Embryonicstem cells,ESCs)、原始生殖细胞(primordial germ cells,PGCs)和精原干细胞(Spermatogonial Stem cells,SSCs),利用Microarray、RNA-seq 技术系统地分析了三种细胞的转录本差异,筛选出参调控鸡雄性性原细胞分化的候选关键基因和信号通路;采用qRT-PCR 对上述结果进行验证。
摘要:本文旨在探索鸡胚胎干细胞(Embryonic stem cell,ESC)向精原干细胞(Spermatogonia stem cell,SSC)分化过程中关键lncRNA 及靶基因,并探究其作用机制,为ESC 体外向SSC 诱导分化体系提供新的依据。以RNA-Seq 技术对鸡ESC、原始生殖细胞(Primordial germ cells,PGC)和SSC进行测序分析,筛选出显著性差异以及特异性表达的候选lncRNAs,以qRT-PCR 对候选lncRNAs在三种细胞中表达趋势变化进行验证,通过BLAST 和RNAplex 软件对候选lncRNAs 进行靶基因预测,同时以DAVID 数据库、WEGO 以及STRING 等在线软件进行功能和蛋白网络互作分析。
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