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CSTPCD 北大核心
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摘要:为全面了解虾夷扇贝(Patinopecten yessoensis)微卫星分布频率和数量,深化对虾夷扇贝基因组的认识,本研究运用第二代高通量测序技术,进行虾夷扇贝简化基因组测序(RAD-seq),从基因组水平阐明虾夷扇贝基因组微卫星特征.结果显示,简化基因组测序共获得序列总长为92,551,435 bp,经过滤筛选,获得259,535个contig,其中,包含微卫星序列3618条,经引物设计共获得3460对微卫星引物.统计微卫星序列的重复类型,其中,三核苷酸重复单元数量最多(1587个,45.87%),其次是二核苷酸重复(1282个,37.05%),六核苷酸重复单元数量最少(20个,0.58%).在三核苷酸重复中,以ATA重复类型所占比例最高(11.41%),共计181个.此外,虾夷扇贝同一重复类型的微卫星随着重复数增加其数量相对减少,而相同重复数的微卫星随着重复单元长度的增加其数量也呈下降趋势,可见微卫星长度与其数量呈负相关,表明长度较短的微卫星变异速率较快.本研究结果为认识虾夷扇贝基因组特征和在基因组水平开展种群遗传学研究提供了基础数据....
摘要:本研究选取山东长岛、辽宁海洋岛和獐子岛底播的虾夷扇贝(Patinopecten yessoensis)群体、人工选育的“獐子岛红”品种养殖群体、辽宁旅顺自然群体以及原产地日本青森县陆奥湾自然群体,运用稳定同位素技术探究虾夷扇贝不同地理群体的特征.结果显示,(1)虾夷扇贝各群体的闭壳肌和内脏团δ13C值分别为-20.47‰±0.66‰和-24.13‰±2.41‰;闭壳肌和内脏团δ15N值分别为8.52‰±1.32‰和7.26‰±0.49‰.(2)基于δ13C值和δ15N值的单因素方差分析(One-wayANOVA)显示,群体间各个取样点闭壳肌和内脏团的碳、氮稳定同位素比值差异显著(P<0.05);基于地理位置构建所有群体的碳氮稳定性同位素散点分布图,可以明显地区别中国群体和日本群体.(3)中国8个虾夷扇贝群体之间,只有长岛群体的碳、氮稳定同位素比值明显低于其他群体,而其余群体之间差异不显著(P>0.05).研究表明,虾夷扇贝中国群体与日本群体间已经存在较大的差异,且中国群体间因生长海域、水文环境的不同也呈现出分群现象.说明虾夷扇贝定居群体在不同的生态环境下已产生了不同程度的适应性改变....
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CSTPCD 北大核心
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摘要:本研究利用线粒体细胞色素b(Cytb)基因标记对虾夷扇贝(Patinopecten yessoensis)6个群体(长岛底播增殖群、海洋岛底播增殖群、獐子岛底播增殖群、旅顺自然群、"獐子红"人工选育群以及日本青森陆奥湾群)进行种质状况评估,研究结果表明,6个群体120个个体的Cytb基因序列共检测到20种单倍型,其中"獐子红"人工选育群单倍型最少,日本群体单倍型最为丰富,两者单倍型多样性指数分别为0.10000和0.88400.分子方差分析(AMOVA)发现,日本群体与中国群体间变异百分比为15.34%,明显高于作为一个基因池时群体间遗传变异水平;就中国组群而言,其83.41%的遗传变异来自于群体内部,组内群体间的变异只占1.52%,说明中国群体个体间的遗传变异远大于群体间的遗传变异.Fst分析显示,中国群体与日本群体之间发生了中等水平的遗传分化(0.07455~0.17895,Fst>0.05).以遗传距离矩阵构建群体间分子系统树(UPGMA树),拓扑结构图显示中国5个群体先聚为一支,再与日本群体聚为一支.由此可见,中国养殖区的虾夷扇贝与日本原产地群体间已出现明显的遗传分化,且虾夷扇贝中国群体的遗传多样性处于较低水平.本研究结果可为虾夷扇贝的种质资源保护与可持续开发利用提供理论依据....
摘要:为建立鲉形目内各物种的快速鉴别方法,本研究扩增了我国47个鲉形目物种并下载了GenBank上收录的鲉形目共计23科85属233种873条细胞色素C氧化酶Ⅰ基因(COI)序列,分析该基因结构特性.结果表明,鲉形目DNA条形码基因的碱基变异中,不变位点508个,占总位点数的82.1%;转换位点70个,颠换位点41个,分别占总位点数的11.3%和6.6%;种内遗传距离为0~0.019,平均遗传距离为0.003±0.0034;属内种间遗传距离为0.003~0.258,平均值为0.086±0.038;基于233个物种的COI序列构建的系统进化树显示,227个物种(97.4%)能聚为独立分支,且具有较高支持度.在此基础上以鲉科11属39种鱼类的DNA条形码为例,筛选出25个种的37个特异性探针,以此探针对鲉科鱼类进行物种快速鉴定成功率为64.1%,研究结果表明DNA条形码芯片用于鲉科的鉴定具有一定的可行性....
摘要:为充分保证港内渔船的停泊及避风安全,对于频繁受到台风影响的渔港,考虑在台风作用下港内及周边水域的波高分布情况,是渔港建设规划设计阶段面临的一项重要内容.结合海南儋州泊潮渔港地理位置及自然条件,采用MIKE21 SW模型,在台风浪计算模型验证可靠的基础上,对工程附近海域及港内的波况进行了数值模拟计算,得到了在台风作用下,计算海域不同重现期的特征波高及分布情况,数值计算结果可以为渔港的规划设计及渔船安全避风提供积极的参考....
[硕士论文] 杨钰
海洋生物学 大连海洋大学 2017(学位年度)
摘要:本研究选取旅顺自然群体,长岛、海洋岛、獐子岛底播群体以及人工选育“獐子岛红”品种养殖群体,对比原产地日本青森县陆奥湾自然群体,运用稳定同位素技术,分析虾夷扇贝中国群体同日本原产地群体间的生理状态、生活环境及摄食习性是否存在差异,并确定其群体结构,以推断虾夷扇贝群体间的相互关系。结果显示,虾夷扇贝各群体的闭壳肌δ13C值范围为-22.26‰~-19.87‰,平均值为-20.47‰,内脏团的δ13C值范围为-25.96‰~-17.86‰,平均值为-24.13‰;闭壳肌的δ15N值范围为5.19‰~9.99‰,平均值为8.52‰,内脏团的δ15N值范围为6.15‰~7.87‰,平均值为7.26‰;基于δ13C值和δ15N值的单因素方差分析显示,经SNK检测,在0.05的显著性水平下,各个取样点闭壳肌和内脏团的碳氮稳定同位素比值具有明显差异;ANOVA分析表明,群体间稳定性同位素比值的差异其主要因素是地理位置的不同所导致的,地理因素的主效应性显著(P<0.05);构建所有群体的碳氮稳定性同位素散点分布图,基于地理位置为依托进行分析,可以明显地将中国群体和日本群体区分开来。对于中国8个虾夷扇贝群体而言,长岛群体的碳、氮稳定同位素比值均明显低于其余群体,而獐子岛3个群体、海洋岛养殖群体、“獐子红”人工选育品种养殖群体以及旅顺自然群体在稳定性同位素比值上并未体现出明显的差异。综上所述,虾夷扇贝中国群体与日本群体间稳定同位素比值已经存在较大的差异,而中国群体则因生长海域、水文环境的不同呈现出分群现象,说明虾夷扇贝定居群体面对不同的生态环境,已产生了不同程度的适应性改变。
  参考六十年代、八十年代、九十年代及近些年北黄海海域水文环境、理化因子及生物资源的调查信息及文献,整理数据并分析北黄海水域生态环境及生物资源的年际变化,同时结合北黄海进行大规模底播扇贝养殖的情况进行综合分析,发现北黄海海域的水文环境未发生较大改变,浮游植物的生物量呈下降趋势,浮游动物的数量呈波动状态。
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