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摘要:研究了径向基网络插值算法与3D曲面重构方法,分别从研究价值、插值理论、仿真等等方面做了详细分析.研究结果表明RBF-Network在逼近一维复杂的非线性函数时具有收敛速度快、精度高、泛化能力更强等优点.但在3D重构方面,基于RBF的单位分解法重构效果更好.
摘要:研究了一类多重泊松模型参数估计的EM算法.首先针对完全数据情形推导出MLE的解析表达式;然后对缺失数据情形设计参数估计的EM算法;最后通过一个算例说明了本文方法的可行性.结果表明EM算法适用于缺失数据情形的参数估计,有较好的估计结果.
[期刊论文] 李苗 李国旗
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北大核心 CSTPCD CSCD CBST
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摘要:为了解罗布麻查尔酮合成酶基因具体结构,采用RT-PCR、RACE方法从夹竹桃科植物罗布麻中扩增出CHS基因的开放阅读框,其核苷酸序列长1 170 bp,推测的氨基酸序列全长为389个氨基酸残基.核苷酸序列同源性分析结果显示,该cDNA片段与其他植物CHS基因的同源性为78%~81%,表明该基因在进化过程中变异程度较小,整个超基因家族序列高度保守.
摘要:查尔酮合成酶基因在植物苯丙氨酸代谢途径中的作用至关重要,直接或间接影响着植物代谢产物合成、抗性调节、花色形成等生理生化过程.为了进一步加强对查尔酮合成酶基因功能的发掘与利用,本研究综合归纳了查尔酮合成酶基因及其克隆、遗传多样性和分子进化等方面研究进展,得出查尔酮合成酶基因克隆采用的主要方法,进而指出查尔酮合成酶基因分异进化研究的未来方向,同时为特色基因资源开发方面研究提供技术资料检索帮助和研究方法参考.
[期刊论文] 李苗 李国旗
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北大核心
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摘要:以Trizol法、改进SDS法及RNA plant plus Reagent试剂盒法提取罗布麻的总RNA,并通过紫外分光光度法和凝胶电泳检测对其提取效果进行比较分析,以筛选出罗布麻总RNA最佳提取方法.结果表明:Trizol法无法有效获得罗布麻总RNA,有较为显著的降解现象;改进SDS法提取的罗布麻RNA总量较少、浓度低,且试验重复性差;RNA plant plus Reagent试剂盒法提取的RNA质量好,纯度高,完整性强,可直接作为后续相关分子生物学试验材料.
摘要:采用水分控制试验,对干旱、半干旱退化荒漠草原治理过程中,土壤种子库对不同日降雨量和不同年降雨量的响应分别进行了研究.结果表明:不同日降雨量对激发土壤种子库物种组成和种子萌发总数均存在显著差异;不同植物种子对自身种子萌发所需水分不同.有的植物仅需很少水分即可萌发,有的植物需要很多的水分才可萌发,还有的植物种子可萌发范围较广;不同年降雨量对激发研究区内土壤种子库物种组成差异不显著,而对激发土壤种子库内可萌发种子数则成波动式的变化.为治理退化荒漠草原、恢复地上植被,建议研究区采用交替施加不同梯度的水分来激发土壤种子库中的种子萌发.
[期刊论文] 李苗 石磊 李国旗
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CSTPCD 北大核心
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摘要:本研究共收集来自于39个不同植物物种的59个查尔酮合成酶基因(CHS)序列,采用生物信息学方法对参试的CHS序列进行基因组成及结构分析,进而通过邻接法构建CHS超基因家族系统进化树.结果显示,CHS广泛分布于不同物种,整个超基因家族序列具有较高同源性;CHS超基因家族在其进化过程中分为2个亚家族,2大亚家族之间遗传距离为0.048,其进化分异程度呈保守态势.参试的所有CHS基因在其指导蛋白合成从而实现性状表达水平较为统一.
[硕士论文] 李苗
生态学 宁夏大学 2015(学位年度)
摘要:基于当前不断加剧的环境压力,对退化土地进行合理开发及高效利用的重要性已日益凸显。针对退化土地的恢复及利用,不仅依靠种植高抗逆性植物,更有必要了解其适应性机理,不断发掘基因资源并加以利用才能够有效缓解日益严重的土地资源危机。本实验以荒漠植物罗布麻(Apocynum venetumL)为材料,采用反转录PCR(RT-PCR)、末端黏粒快速扩增(Rapid-amplification of cDNA ends)等方法从罗布麻中扩增出查尔酮合成酶(CHS)编码基因的cDNA序列,开展罗布麻不同构件查尔酮合成酶基因表达量半定量分析,并综合现有数据库资源通过生物信息学手段对查尔酮合成酶基因进行分子进化研究,得到以下结论:
  1.AvCHS的克隆。查尔酮合成酶是罗布麻所含类黄酮类物质合成前体及与抗性相关次生代谢产物合成关键酶,克隆得到的罗布麻查尔酮合成酶基因被定名为AvCHS,AvCHS的cDNA全长为1476bp,包含一个完整的开放阅读框(Open reading frame),长度为1170bp,推测其编码的氨基酸序列全长为389个氨基酸残基。
  2.AvCHS同源性分析。AvCHS与漆树科盐肤木及蔷薇科植物欧洲李CHS基因序列一致性较高,现已克隆得到的大部分CHS基因核苷酸序列均与AvCHS具有78%以上一致性。CHS基因在高等植物之间具备很高的保守性。
  3.罗布麻不同构件AvCHS表达半定量分析。通过RT-PCR,以18S rDNA PCR产物作为内标,对罗布麻植株根、茎、叶和花不同构件AvCHS基因表达量进行半定量分析。测定结果表明:罗布麻植株中,花构件AvCHS基因表达量最高,根、叶构件次之。因而,罗布麻的强生态适应性及其经济价值与AvCHS基因表达量均有直接关系。
  4.AvCHS分子进化。在完成AvCHS完整序列测定基础上,比对相关植物CHS基因序列,通过矩阵距离法构建CHS基因系统进化树。对核苷酸、氨基酸系统进化树的生物信息学分析表明:AvCHS属于CHS超基因家族,与参试CHS序列的相似性系数最高达到92%; CHS超基因家族在其进化过程中分化为2个亚家族,2大亚家族之间遗传距离为0.048,AvCHS属于第Ⅰ大亚家族。参与比较的所有CHS基因,其编码的氨基酸具备较高的同源性。AvCHS所属Ⅰ大类可依据遗传距离定义出十余个不同植物蛋白分异类群。可以推断CHS蛋白其总体结构较为保守,少部分在环境因子影响下呈现出细微的结构、功能差异。
  研究结果明确了罗布麻查尔酮合成酶基因结构,对其在CHS基因家族中的归属进行了划分。此外,结合系统进化与生态特征分析,划分出不同基础生态类型,为利用其优秀特异基因及整体基因资源挖掘奠定理论基础。
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北大核心 CSTPCD CSCD CBST
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摘要:采用RT-PCR、RACE等方法从超旱生、耐盐植物梭梭(Haloxylon ammodendron)中扩增出EF-handCaBP(EF-hand calcium-binding protein)基因的cDNA序列(GenBank登录号为JQ023165),其开放阅读框为732 bp,推测的氨基酸序列全长为243个氨基酸残基.运用SMART、GOR4、TMPred等生物信息学软件对梭梭EF-hand CaBP功能域、跨膜结构进行分析湿示,梭梭EF-hand CaBP含有26个氨基酸的信号肽序列及4个保守的钙结合位点(EF-hand),并且存在2种跨膜模型,推测梭梭EF hand CaBP基因可能定位于液泡膜或叶绿体膜上.
摘要:本研究以马铃薯(Solanum tuberosum L.)试管薯作为转化受体,利用农杆菌介导法将从梭梭中获得的甜菜碱醛脱氢酶基因(HaBADH)转化马铃薯,采用正交试验设计优化了影响马铃薯转化的4个主要因子,建立了农杆菌介导的马铃薯高效转化体系,获得了转基因植株.研究结果表明,转化过程中,浸染时间15 min,菌液浓度OD600为1.0,筛选培养时卡那霉素浓度30 mg/L、品种为大西洋为最佳转化方案,抗性芽分化率最高达到了35.9%;4个因子中基因型对转化效率影响最大,菌液浓度的影响次之,卡那霉素浓度和浸染时间的影响最小.经PCR、RT-PCR及Southern blot检测,证明了HaBADH基因整合到马铃薯中,阳性转化率为45.3%.
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北大核心 CSTPCD CSCD AJ CA CBST
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摘要:采用RT-PCR、RACE等方法从超旱生耐盐植物梭梭(Haloxylon ammodendron)中扩增出甜菜碱合成过程中的限速酶胆碱单加氧酶(CMO)编码基因的cDNA序列(命名为HaCMO),其开放阅读框为1 344 bp,推测的氨基酸序列全长为447个氨基酸残基.根据已获得的开放阅读框,构建重组植物表达载体pCAMBIA2300-HaCMO.HaCMO核苷酸序列与藜科几种盐生植物如菠菜(Spinacia oleracea)、山菠菜(Atriplex hortensis)、辽宁碱蓬(Suaeda liaotungensis)、盐角草(Salicornia europaea)和甜菜(Beta vulgaris)等的一致性均在74.5%以上,推导编码蛋白的氨基酸序列一致性均在73.5%以上,表明CMO编码基因在藜科植物中是一种比较保守的基因.研究结果为进一步从分子水平探明梭梭的抗旱、耐盐机制,挖掘并利用植物抗逆基因奠定了基础.
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北大核心 CSTPCD CSCD AJ CA CBST
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摘要:采用RT-PCR、RACE等方法从超旱生、耐盐植物梭梭(Haloxylon ammodendron)中扩增出BADH基因的cDNA序列(命名为HaBADH),其开放阅读框为1 503 bp,推测的氨基酸序列全长为500个氨基酸残基,并含有醛脱氢酶所具有的高度保守的十肽(VTLELGGKSP)以及与酶功能有关的半胱氨酸残基(C).其核苷酸序列与藜科几种盐生植物如盐爪爪(Kalidium foliatum)、中亚滨藜(Atriplex centralasiatica)、三角叶滨藜(Atriplex triangularis)、菠菜(Spinacia oleracea)、山菠菜(Atriplex hortensis)和甜菜(Beta vulgaris)等的相似性均在85%以上,推导编码蛋白的氨基酸序列一致性均在87%以上,表明BADH基因在藜科植物中是一种比较保守的基因.研究结果为进一步从分子水平探明梭梭的抗旱、耐盐机制,挖掘并利用植物抗逆基因奠定基础.
摘要:采用酸蚀、药剂、低温层积以及清水浸泡结合变温处理方法对破除马蔺、大苞鸢尾2种鸢尾属植物种子休眠及诱导和提高种子萌发率进行了研究.结果表明:单一的酸蚀、药剂、低温层积的处理方法对破除马蔺、大苞鸢尾种子的休眠,提高种子萌发率作用不明显;通过清水浸泡结合变温处理对马蔺和大苞鸢尾的种子萌发率的提高作用较为显著,分别达到30.37%、10.74%.
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北大核心 CSTPCD CSCD CA
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摘要:肉苁蓉(Cistanche deserticola Y.C.Ma)是一种沙生根寄生濒危药用植物.采用石蜡切片法,利用光镜观察,对内苁蓉雌雄配子体发育进行了系统研究.结果表明:花药壁由5层细胞组成,分别为表皮、药室内壁、中层(2层)和绒毡层,绒毡层细胞起源具异型性,发育类型为腺质型.小孢子母细胞胞质分裂为同时型,四分体为四面体型,成熟花粉粒为2-细胞型,部分败育.大孢子由单个孢原细胞直接发育为大孢子母细胞,大孢子母细胞减数分裂形成线状四分体,珠孔端3个大孢子最后退化,且退化顺序不一,大部分胚囊中的大孢子从合点端第2个开始退化,合点端大孢子为功能大孢子并发育为单核胚囊,胚囊发育属蓼型.研究结果为内苁蓉资源的保护提供细胞学依据.
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北大核心 CSTPCD CSCD CA CBST
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摘要:肉苁蓉(Cistanche deserticola)是一种沙牛根寄生濒危药用植物.利用光镜和电镜手段,采用人工培养和诱导等方法详细观察并研究了肉苁蓉寄牛牛长过程中种子萌发、吸器产生以及植物体形态发育的过程.结果表明:(1)人工可以诱导肉苁蓉的种子萌发.肉苁蓉种胚具有明显的极性,珠孔端细胞小于合点端,珠孔端细胞分化、生长并产生白色的类胚根状结构.(2)有些化学物质可以诱导初生吸器的产生.用2,6二甲氧基-对苯醌培养肉苁蓉24-26小时后,其先端膨大并产生突起,形成类似根毛状的结构,即初生吸器.(3)肉从蓉属于主动寄生植物,其在初生吸器与寄主幼根黏连后产生次生吸器.肉苁蓉与寄主梭梭(Haloxylon ammodendron)共培养,其初生吸器主动与寄主幼根(0.1 mm左右)黏连,穿过寄主根表皮和皮层后与维管束连通形成次生吸器,肉苁蓉植物体分化、发育的基本组织形成.被寄生后的寄主根横向发育加快,同时肉从蓉植物体开始分化和发育.(4)肉苁蓉可以寄生在寄主幼根(0.1 mm左右)的任意部位.
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北大核心 CSTPCD CSCD AJ CA CBST
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摘要:在自然居群中通过野外定位观测,运用杂交指数(OCI);花粉-胚珠比(P/O);去雄、套袋、人工授粉等方法对濒危植物肉苁蓉(Cistanche deserticola Ma)的花序发育、开花特性、花粉活力、柱头可授性、传粉方式、繁育系统进行了研究,结果表明:肉苁蓉穗状无限花序的生长发育期可明显分为拱土期、出土期、开花期、结实与种子成熟期四个阶段.两性花,单花开放时间2~3 d,花序有花期持续20~25 d.种群开花历时36~38 d.开花时柱头略高出花药,柱头较大,下垂.重力玻片法检测,风媒导致的异株异花传粉完全可以忽略.主要访花昆虫为蜂类.扫描电镜观察虫体,蜂类携带大量花粉,但传粉飞行距离大部分为0.杂交指数为3;花粉-胚珠比为35.45±8.56;结合去雄、套袋和人工授粉试验结果,认为肉苁蓉属于以自交为主的繁育系统.
摘要:研究了肉苁蓉(Cistanche deserticola)基因组DNA的分离提取方法.由于肉苁蓉组织内含有大量的多糖类及蛋白等物质,严重干扰DNA的抽提,在对其进行若干预处理之后,采用改进的CTAB法提取基因组DNA.根据外观、琼脂糖凝胶电泳检测、D260/D280的测定和PCR扩增表明,用改进的CTAB法提取肉苁蓉基因组DNA,所得DNA无论是纯度还是完整性都比较好,可以直接用于RAPD反应体系.
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北大核心 CSTPCD CSCD CBST
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摘要:为深入了解肉苁蓉(Cistanche deserticola)的寄生生长特性,对其种子的休眠及萌发特性进行了研究.采用整体透明法观察了种胚的发育情况;TTC法测定了种子活力;物理方法(水泡、变温、层积等)和化学方法(激素、独脚金酚化学合成类似物GR 24、中草药、白刺根、寄主梭梭根的浸提液等)分别对种子进行萌发诱导处理,观察促进萌发情况.结果表明,肉苁蓉种子较小,千粒重仅为0.096 g,成熟的种子胚发育不完全,萌发前后始终处于球形胚阶段.具有活力的种子占25.3%.采用室温水处理30 d,并以GA3(0.5 μg/ml)培养种子,在恒温25℃条件下,萌发率最高,可达16.7%.部分中草药、白刺根的浸提液对肉苁蓉种子萌发有一定的促进作用,但GR 24、寄主梭梭根浸提液对肉苁蓉种子萌发没有促进作用.试验结果证实,肉苁蓉种子存在休眠现象,种子萌发的启动,除了需要有较长时间的后熟过程,必须有来自寄主根系的某种萌发刺激信号.肉苁蓉种子的休眠及萌发特性和非寄生植物及一些寄生植物有很大不同.
摘要:目的 为扩大和提高肉苁蓉Cistanche deserticola资源的利用效率.方法 以肉苁蓉肉质茎的不同组织部位作为外植体,采用正交实验方法,筛选诱导愈伤组织产生的不同培养基和培养条件,并继代培养.应用HPLC方法对愈伤组织培养物中松果菊苷和洋丁香苷(毛蕊花糖苷)的量进行测定.结果 肉苁蓉肉质茎的维管组织部分是诱导愈伤组织的最适外植体,鳞片叶次之,髓组织部分诱导效果较差.在暗培养、25~27℃条件下以B5为基本培养基附加6-BA(0.5~2 mg/L)与IAA(0.5~1.5 mg/L)诱导愈伤组织效果最佳;在半光照(光培养10 h/d,暗培养14h/d)条件下,愈伤组织生长正常,最佳继代时间为25~30 d.愈伤组织培养物中松果菊苷和洋丁香苷(毛蕊花糖苷)达4.37%.结论 筛选出了适宜的肉苁蓉愈伤组织培养方法,且培养物中主要药用有效成分松果菊苷和洋丁香苷(毛蕊花糖苷)的量达到并超过了<中国药典>要求(0.3%)的标准.
摘要:为研究野生肉苁蓉(Cistanche deserticola Ma)种群内变异类型,采用形态学指标和RAPD标记技术,计算种群内不同类型个体间遗传相似性系数,建立UPGMA聚类图。结果表明,内苁蓉种群内存在多种变异类型,且变异程度不尽相同。利用形态学指标和RAPD技术相结合的方法,能够明确划分出种群内个体变异类型。
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