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摘要:为深入了解家禽肉品质性状形成的分子机制,本实验测定金茅黑鸡胸肌的肉品质,利用RNA-seq技术进行转录组测序,分析转录组基因表达量与肉品质性状间的关联性.结果显示:与金茅黑鸡14周龄肉色显著相关的基因5个,pH57个,剪切力33个,系水力17个;PLEKHS1、MUC等基因为影响肉色的候选基因,LHX9、SPDEF、GRXCR1等基因为系水力的候选基因,NPY、POMC、FGF20、MGAT4C和GUK1基因为影响肌肉pH的候选基因,EDAR基因和HS6ST3基因为肌肉剪切力的主要候选基因;功能分析发现这些基因在调节肌肉纤维、肌间脂肪沉积、脂类代谢、糖代谢过程和磷酸二酯酶水解等方面发挥重要作用,进而影响胸肌肌肉品质的形成....
[期刊论文] 刘忠慧 李国辉 狄和双
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北大核心 CSTPCD
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摘要:以GH和CRBP4基因作为影响鸡繁殖性状的候选基因,采用PCR-SSCP方法检测仙居鸡GH基因外显子4和CRBP4基因外显子3区域的单核苷酸多态性,并分析GH、CRBP4单基因型及2个基因合并基因型与65周龄产蛋数的关联。结果表明:GH基因exon4(C2338G/C2341T)的突变和CRBP4基因exon2的突变(C826T)基因型CC型与该鸡品种的65周龄产蛋数显著相关(P<0.05),AA、CC型对产蛋数的加性效应分别为3.56、3.60;合并基因型AACC型个体65周龄产蛋数与对照组相比差异显著(P<0.05);2个基因间的互作效应不显著(P>0.05)。...
摘要:本试验通过对京海黄鸡卵巢组织进行转录组分析,旨在为完善京海黄鸡部分基因结构和发掘新基因提供参考.选取高、低产京海黄鸡各4只,利用转录组测序(RNA-Seq)技术对其卵巢转录组进行测序,然后对得到的测序数据进行生物信息学分析.测序数据经过质量控制后,8个样品共得到484 992 074条有效数据(Clean Reads),总计61.09 Gb.筛选出1 445 264个京海黄鸡品种内SNP位点,其中位于基因区的SNP位点916 108个,位于基因间区的SNP位点552 168个.8个样品中平均新预测的可变剪接12 883个,并对7 481个基因结构进行了优化.与所选的参考基因组序列对比分析,共发掘4 431个新基因,通过与各数据库进行序列对比,1 809个新基因得到功能注释.本研究通过转录组测序技术检测了京海黄鸡卵巢组织的基因结构,为进一步完善京海黄鸡的基因结构信息及发掘潜在的新基因提供分子水平的依据....
摘要:试验旨在寻找影响京海黄鸡禽流感抗病性状的分子标记.本研究以京海黄鸡核心群母鸡为基础,测定了血清中的禽流感(H5亚型)抗体滴度,利用简化基因组测序技术进行全基因组关联分析(genome-wide association studies,GWAS),检测与禽流感抗体滴度相关的SNP位点.结果发现2个在染色体水平上与禽流感抗病性状显著相关的SNPs位点,分别位于4号和10号染色体上,其中10号染色体上的SNP位于RNA甲基转移酶家族基因Nsun7内部.该基因与细胞增殖和分化、蛋白质的生物合成密切相关,具有重要的生物学功能,推断其可作为影响京海黄鸡禽流感抗病性状的新的候选基因....
摘要:试验旨在寻找影响京海黄鸡γ-干扰素(IFN-γ)水平的分子标记.本研究以京海黄鸡核心群母鸡为基础,测定了血清中INF-γ的浓度,利用简化基因组测序技术进行全基因组关联分析(GWAS),检测与INF-γ浓度相关的SNPs位点.结果共检测到1个在基因组水平上与其潜在显著相关的SNP位点,并达到染色体显著水平.该SNP位于2号染色体上MYOM1基因内部.使用GO数据库对该基因的细胞组分、分子功能和参与的生物进程进行分析,由结果推断MYOM1基因可能为影响京海黄鸡细胞因子INF γ水平的重要候选基因....
摘要:为了研究GnRHR基因与GHR基因在文昌鸡和隐性白羽肉鸡群体中的遗传变异情况,运用连接酶检测反应(PCR-LDR)对GnRHR基因的537 bp位点与GHR基因的571 bp位点进行基因分型,并分析了该位点在群体中的基因型、基因频率和Hardy-Weinberg平衡情况以及与产蛋性能的关系.结果显示:GnRHR基因的537 bp位点在文昌鸡与隐性白羽肉鸡群体中仅检测到CC一种基因型,文昌鸡与隐性白羽肉鸡GnRHR基因型的频率(CC)和基因频率(C)均为1;GHR基因的571bp位点在文昌鸡与隐性白羽肉鸡群体中仅检测到TT一种基因型,文昌鸡与隐性白羽肉鸡的GnRHR基因型频率(TT)和基因频率(T)均为1;且在这2点均处于Hardy-Weinberg平衡(P>0.05)....
摘要:将GH、POU1F1和PRL基因作为影响鸡繁殖性状的候选基因,以白耳鸡为试验材料,采用PCR-SSCP方法检测白耳鸡GH 、POU1F1和PRL基因单核苷酸多态性,分析这3个基因的单基因以及聚合基因型对白耳鸡72周龄产蛋数影响.结果表明:GH 、POU1F1和PRL基因均对白耳鸡72周龄产蛋数的差异产生影响,与鸡的产蛋数存在关联,AA、CC、EE型为优势单基因型;优势单基因型两两聚合的遗传效应高于优势单基因型的遗传效应;3个优势单基因型聚合(AACCEE型)遗传效应又高于优势单基因型两两聚合的遗传效应,因此我们推断可能聚合的优势单基因型越多,对白耳鸡72周龄的产蛋数影响效应越大,所以可以尝试利用聚合基因型对白耳鸡的72周龄产蛋数进行标记辅助选择....
摘要:以GH和POU1F1作为影响鸡繁殖性状的候选基因,采用PCR-SSCP方法,检测白耳鸡GH外显子4和POU1F1外显子3区域的单核苷酸多态性,并利用最小二乘法分析GH、POU1F1单基因型和两基因聚合基因型与72周龄产蛋数的关联.结果表明,GH基因exon4(C2338G\C2341T)的突变和POU1F1基因exon3的突变(A5331T)基因型CC与白耳鸡的72周龄产蛋数显著相关(P<0.05),基因型AA、CC对产蛋数的加性效应分别为3.80和3.57.聚合基因型AACC个体72周龄产蛋数(除基因型ABCC外)与对照组差异显著(P<0.05).两基因间的互作效应不显著(P>0.05).扩繁F1代聚合基因型AACC个体72周龄产蛋数与前一世代相当....
摘要:以7日龄皖西白鹅为试验对象,研究(12±1)℃室温条件下进行0、0.5、3、6、12和24 h急性冷应激对皖西白鹅雏鹅血常规指标变化的影响.研究结果表明,在冷暴露至结束冷暴露后,全血中红细胞(RBC)、红细胞压积(HCT)、血红蛋白(HGB)、红细胞分布宽度(RDW)总体呈减少趋势,且RBC在冷暴露3 h、6 h和冷暴露结束后0.5 h和3 h极显著低于冷应激前的水平;HCT 和HGB在冷暴露3 h、6 h和冷暴露结束后3 h显著低于冷应激前的水平;RDW在冷暴露6 h后至结束冷暴露后12 h期间均极显著低于应激前水平(P<0.01).白细胞在冷暴露12 h和24 h时显著升高.淋巴细胞绝对值在冷暴露6 h时显著低于应激前的水平(P<0.05),淋巴细胞百分比在冷暴露后3 h、6 h和12 h时显著升高(P<0.01), 但冷应激24 h已经恢复正常,雏鹅已经开始适应.表明皖西白鹅雏鹅抗冷应激能力很强....
摘要:以7日龄皖西白鹅为试验对象,研究在12±1 ℃室温条件下进行急性冷应激处理对下丘脑-垂体-肾上腺皮质(HPA)轴和下丘脑-垂体-甲状腺(HPT)轴的影响.结果表明,FT3在冷暴露6 h和12 h时显著升高.FT4冷暴露3 h显著升高(P<0.01),随后逐渐下降,至结束冷暴露后12 h显著降低(P<0.05).T3在冷暴露过程中逐渐升高,在冷暴露6 h、结束冷暴露后0.5 h和3 h时明显高于应激前水平.T4在冷暴露6 h、结束冷暴露后6 h时达到峰值.Cor在冷暴露3 h时显著升高(P<0.05),并在冷暴露期间保持高水平. 血清中ACTH随冷暴露时间延长而逐渐升高,在冷应激3 h时显著高于应激前的水平(P<0.01),至冷暴露结束后3 h时,ACTH再次明显升高(P<0.05)....
摘要:采用PCR-RFLP方法,榆测了小梅山猪和大白猪骨形成蛋白15(BMP15)基因exon2的多态性,结果显示,在这2个品种中均有A和B两个等位基因存在.利用最小二乘分析研究了该多态位点对猪头胎,二胎和经产的总产仔数和产活仔数的影响.结果表明,在小梅山猪中.不同基因型经产母猪的总产仔数和产活仔数间差异显著,AA产活仔数最高,为14.28头,BB总产仔数和产活仔数最低,分别为12.67头和12.33头;大白猪中,不同基因型母猪在头胎总产仔数和经产总产仔数方面差异显著,其他方面差异均不显著,但都呈现出AA>AB>BB的趋势....
摘要:根据GenBank公布的猪OPN基因,设计3对引物,采用微卫星标记技术和PCR-SSCP技术检测猪OPN基因的多态性.结果显示,引物P1位点上检测到5个等位基因和4种基因型,引物P2和P3上分别存在2个等位基因和2个基因型.遗传多态性分析结果表明,P1位点上,小梅山猪的纯合度最高,为0.518,大白猪纯合度最低,为0.290.P2和P3位点上两个品种纯合度差异不大;大白猪的群体平均杂合度大于小梅山猪,其杂合度分别为0.481、0.388....
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北大核心 CSTPCD CSCD AJ CA CBST
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摘要:以MC4R和POU1F1基因为候选基因,采用PCR-SSCP和DNA测序技术检测两个候选基因在京海黄鸡群体中的单核苷酸多态性(SNPs),同时对候选基因与京海黄鸡生长性能的相关性进行了研究.结果表明,MC4R基因编码区第662bp位置有G→C碱基的点突变,在京海黄鸡中检测到AA、AB、BB 3种基因型,A等位基因频率为0.929,B等位基因频率为0.071;在POU1F1基因exon3在序列的第5 231 bp位置有一个A-T碱基的点突变,检测到CC、CD、DD 3种基因型,C等位基因频率为0.500,D等位基因频率为0.500.采用GLM模型分析基因型对生长性能的遗传效应,结果表明,MC4R基因AA基因型个体的4、8、12周龄体重显著地高于BB型个体(P<0.05),16周龄体重差异极显著(P<0.01);POU1F1基因CD基因型个体体重极显著高于CC型和DD型(P<0.01).因此推测MC4R和POU1F1基因可能是影响鸡生长性状的主效基因或与主效基因紧密连锁的标记基因,能够在分子标记辅助选择中用于对鸡生长性状的遗传改良....
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北大核心 CSTPCD CSCD CA CBST
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摘要:[目的]为深入研究鸡MC4R基因和分子育种提供参考.[方法]采用饱和酚/氯仿法从鸡血中提取DNA,利用PCR-SSCP和DNA测序的方法,对京海黄鸡MC4R基因的单核苷酸多态性进行分析.[结果]对PCR产物进行SSCP分析,2对引物均表现出多态性.引物A得到2种基因型(AA型和AB型).引物Z也得到2种基因型(CC型和CD型).将测序结果与发表的鸡MC4R基因序列的比较结果进行比较,发现2个单核苷酸多态位点,其中A引物扩增序列中的多态位点为662 bp处G→C的点突变造成的,而Z引物扩增序列中的多态位点是由于在733~734 bp插入了一个C碱基引起的.[结论]该研究中未检测到BB和DD纯合基因型,这可能与在京海黄鸡培育过程中采用分子标记方法进行选择有关....
摘要:采用PCR-SSCP和DNA测序技术检测POU1F1基因在京海黄鸡中的单核苷酸多态性(SNPs),并对不同基因型与京海黄鸡生长性能的相关性进行了分析.结果表明:在POU1F1基因第三外显子第5 231 bp位置有A→T碱基的点突变,在京海黄鸡群体中检测到AA、AB、BB 3种基因型,A等位基因的频率为0.500,B等位基因的频率为0.500.基因型与生长性能的关联分析得知:POU1F1基因不同基因型显著影响京海黄鸡各周龄体重,AB型显著高于从型和BB型(P<0.01).因此,推测POU1F1基因可能是影响鸡生长性状的主效基因或与主效基因紧密连锁的标记基因,并且能够在分子标记辅助选择中用于对鸡生长性状的遗传改良和固定....
摘要:研究以140只京海黄鸡为试验材料,以MC4R为候选基因,采用PCR-SSCP和DNA测序技术分析了MC4R基因在京海黄鸡群体中的多态性.结果表明:MC4R基因编辑区第662bp处有G→C碱基的点突变,在京海黄鸡中检测到AA、AB、BB 3种基因型,A等位基因的频率为0.929,B等位基因的频率为0.071.经过基因型与生长性能的关联分析得知:不同基因型与京海黄鸡4、8、12周龄体重差异显著(P<0.05),与16周龄体重差异极显著(P<0.01).由此推测,MC4R基因可能对于鸡生长性能具有很大的影响或与控制生长性能的主基因连锁....
[专利] 发明专利 CN201910466119.0
扬州大学 2019-09-20
摘要:本发明公开了一种单粒米测定水稻直链淀粉含量的方法,包括选择直链淀粉含量不同的多个水稻品种作为参照样品;分别测定直链淀粉含量;将参照样品和待测样品的稻谷烘干至恒重,分别选取单粒,去壳称重,加入NaOH溶液,进行震荡;加水至NaOH溶液和水的总体积为第一体积,离心取上清液,加入等体积的冰醋酸溶液和碘‑碘化钾溶液,加水至第二体积,静置,得到显色液;测定吸光度值,以参照样品的直链淀粉含量为纵坐标,吸光度值折算成的0.025g米粒的吸光度值为横坐标,制作标准曲线,或获得回归方程式;根据待测样品的吸光度值折算成的0.025g米粒的吸光度值计算得到直链淀粉含量。本发明独特新颖,可以通过单粒米测定水稻直链淀粉含量,测量准确可靠。
[博士论文] 李国辉
动物遗传育种与繁殖 扬州大学 2019(学位年度)
[期刊论文] 李国辉 张国 崔克辉
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CSTPCD 北大核心
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摘要:本研究以来源于‘珍汕97’和‘明恢63’重组自交系群体的4个家系R46、R94、Rl18和R232为材料,在低氮和高氮处理下分析了水稻穗颈大、小维管束形态解剖特征及其与茎鞘非结构性碳水化合物(non-structural carbohydrates,NSC)转运和产量形成的关系.研究结果表明,不同家系穗颈大、小维管束数量表现出基因型差异.增施氮肥分别增加了大、小维管束的数量、横截面积和韧皮部面积.大、小维管束的数量、总横截面积分别与茎鞘NSC转运、结实率、千粒重和产量显著正相关,小维管束的相关系数高于大维管束;小维管束韧皮部面积与茎鞘NSC转运显著正相关,而大维管束无显著相关性;小维管束与大小维管束的总数量比、总横截面积比、总韧皮部面积比、以及小维管束韧皮部面积与大小维管束总横截面积比分别与茎鞘NSC转运、结实率、千粒重和产量正相关,而大维管束表现为负相关.这些结果表明小维管束对茎鞘NSC转运和产量形成的作用比大维管束大,大、小维管束韧皮部在茎鞘NSC转运中的功能差异可能是主要原因.因此,选择穗颈维管束多且小维管束多的水稻品种或采用适当栽培管理改良维管束特征,尤其是增加小维管束数量和韧皮部面积有利于茎鞘NSC向籽粒转运和增加产量....
摘要:水稻灌浆期叶片光合产物和花前茎鞘储存的非结构性碳水化合物以蔗糖的形式向穗转运,是籽粒灌浆的物质来源.韧皮部装载是水稻叶片和茎鞘蔗糖向籽粒转运的第一个关键步骤.增强韧皮部装载有利于促进叶片和茎鞘蔗糖向籽粒高效转运,是提高水稻产量的重要途径.本文重点综述了水稻蔗糖韧皮部装载策略、生理过程和关键蔗糖载体蛋白的基因表达及调控等研究进展,并探讨了其与水稻产量形成的关系....
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