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[期刊论文] 王欣 马莹 胡中立 徐辰武
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CSTPCD 北大核心
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摘要:[目的]在亲本一般配合力的基础上优选特殊配合力高的杂交种,是水稻杂种育种的关键.基因组选择基于覆盖全基因组的分子标记和样本的表型数据建立预测模型,实现对品种更加可靠的选择.[方法]本研究利用一组基于不完全双列杂交(NCII设计)的水稻数据集,考查其多个农艺性状配合力的基因组预测能力.并比较了不同训练群体构建方法对杂交种表型预测能力的影响.[结果]8个农艺性状一般配合力的预测能力由其遗传率主导,从0.3888到0.7367.杂交种特殊配合力的预测能力较低,但是直接预测杂交种的表型可以获得较高的预测能力.[结论]基因组预测水稻亲本一般配合力是有效的,能够帮助育种家实现对亲本的科学选择.如果要选配杂交种,直接预测杂交种表型是最有效的手段.此时让更多的亲本均衡地参与杂交种训练集的组配,有利于获得更高的预测能力....
摘要:以72个小麦叠氮化钠诱变品系为试验材料,检测该群体的蛋白质含量、湿面筋含量、沉降值和淀粉含量4项籽粒品质指标,分析该群体的遗传多样性及相关性,并估计其遗传参数.结果表明,籽粒淀粉含量的多样性指数最高,为1.7837,其后遗传多样性指数由大到小依次是蛋白质含量>沉降值>湿面筋含量,蛋白质含量和湿面筋含量的变异系数比沉降值和淀粉含量的大.4个籽粒品质性状间的简单相关和偏相关均极显著.只是蛋白质含量和沉降值简单相关系数为-0.9679,而其偏相关系数为0.5462,湿面筋含量和淀粉含量之间简单相关系数为0.9320,偏相关系数却是-0.6858.蛋白质含量、湿面筋含量、沉降值的选择潜力比淀粉含量大,更有可能从该群体中选出偏离平均数大的家系类型....
[期刊论文] 胡雅 潘亮 徐辰武
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北大核心 CSTPCD
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摘要:玉米Dwarf8基因是显性矮化基因,由于其突变体在DELLA区的碱基缺失而使其呈组成型表达抑制GA响应,从而表现出植株矮小,种子发芽率低,叶片呈暗绿色等特性。对玉米Dwarf8基因在来源广泛的96份玉米自交系中进行了目标序列重测序,并与株高和穗位高2个株型性状以及穗长、穗粗、轴粗、穗质量、行粒数、穗行数和粒质量7个穗部性状进行关联分析。 Dwarf8基因在供试玉米自交系中共有66个变异位点,包括18个SNP和48个InDel。在编码区发现24个变异位点,包括6个SNP和18个InDel位点。关联分析发现,玉米Dwarf8基因中1个非同义突变位点与株高显著关联,另外1个非同义突变位点与穗长显著关联。...
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北大核心 CSTPCD CSCD CA CBST
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摘要:2001-2011年(不含2004年)10年间对江苏省五大湖泊(太湖、滆湖、洪泽湖、高宝邵伯湖和骆马湖)的水体重金属浓度进行长期定点监测,按系统分组资料进行方差分析,以比较各重金属浓度在湖泊间的差异显著性,并在此基础上应用多指标综合评价法(TOPSIS法)对5个湖泊水体重金属进行综合比较.结果表明:除铜浓度外,5个湖泊间铅、镉、汞和砷4个指标浓度均存在极显著差异;5种重金属浓度湖泊内站位间均差异不显著;铅、镉和汞浓度站位内年份间差异显著或极显著.TOPSIS分析结果表明,总体而言高宝邵伯湖水体重金属污染程度最小,骆马湖水体重金属污染程度最大,洪泽湖、太湖和滆湖水体重金属污染综合评价优劣相当....
[期刊论文] 喻俊杰 金艳 张勇 徐辰武
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北大核心 CSTPCD CSCD AJ CA CBST
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摘要:为了从分子水平上明确江苏省小麦品种资源的遗传多样性水平,选用138对微卫星分子标记(SSR)对江苏省近40年来的90份主栽小麦品种的遗传多样性进行研究.结果表明,在90份主栽品种中,138个SSR位点共检测到542个等位变异,平均每个位点有3.93个等位变异,变化范围2~11;多态性信息含量(PIC值)变化范围为0.032 6~0.824 5,平均为0.415 1;基因组的平均等位变异及PIC值均为B>A>D;对90个品种按照所应用的麦区可分为淮北麦区品种(45个)和淮南麦区品种(45个),淮北麦区品种平均PIC值为0.428 7,淮南麦区品种平均PIC值为0.356 6,淮南麦区品种基因多样性和PIC值显著低于淮北麦区,并且不同时期淮北和淮南麦区品种的遗传多样性也存在不同的变化趋势....
摘要:以水稻9311为背景、日本晴为供体构建的一套染色体片段代换系为试验材料,利用 HL 型籼稻不育系粤泰A 与代换系测交,根据测交 F1群体的花粉育性和小穗育性,结合 Bin -map,采用多元回归的方法,对 HL 型粤泰 A 的育性恢复 QTL 进行分析。以花粉育性为指标检测到3个 QTLs,分别位于第2、6和10染色体上,定位区段大小为379262、1853725、1229303 bp;以自然小穗育性为指标检测到3个 QTLs,分别位于第1、第3和第11染色体上,定位区段大小为455070、525340、247226 bp。...
摘要:对2001—2011年(不含2004年)10年间江苏省5个主要湖泊的渔业水质监测数据按系统分组资料进行方差分析,比较湖泊间各监测指标的差异显著性,并应用多指标综合评价法(TOPSIS法)对5个湖泊水质进行综合评价。结果表明,除铜含量外,5个湖泊间的水温、透明度、溶解氧等14个指标均存在极显著性差异;湖泊内站位间的透明度、总氮、总磷差异极显著;站位内年份间的pH值、化学需氧量、石油类、总磷、铅、镉、汞差异显著或极显著;渔业水质最好的是高宝邵伯湖,骆马湖水质与之相当,其后依次为洪泽湖、太湖、滆湖,5个湖泊的水质由南向北越来越好,这与江苏南北工业经济发达程度呈高度的关联性。...
摘要:基于2001—2011年洪泽湖水质溶解氧、高锰酸盐指数、总氮、氨氮和总磷长期定位监测数据,采用物元分析法研究洪泽湖渔业水质监测站位的优化布设。结果表明,用物元分析法将原来的21个监测站位优化为14个,监测点位优化后对监测结果无明显影响。...
[期刊论文] 王伟 宋雯 尹双义 徐辰武
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北大核心 CSTPCD CSCD AJ CA CBST
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摘要:为了探讨江苏省稻米重金属镉检测多级抽样最佳试验方案,本文以一个三级抽样检测结果为例,经方差分析F检验,发现地市间和样点村间差异均极显著,各级误差方差以地市间最大。在此基础上,探讨了在一定精确度保证下的最优配置抽样方案。结果表明,为了提高调查的精确度,在经费许可的条件下可采用随机抽取6个地市,每个地市随机抽取20个样点村或农技推广站,每个样点村随机重复2次的抽样方案;若资金较为紧张,在保证当前精确度的基础上,亦可以采用随机抽取6个地市,每个地市随机抽取10个样点村或农技推广站,每个样点村随机重复2次的抽样方案。...
摘要:由于缺乏中国农产品消费量的详细数据,现有的精细膳食暴露评估模型难以被直接使用,急需构建适用于评价中国农产品质量安全的新模型.本研究以农产品中危害因子的化学物浓度参数为关注点,从参数设置、模型假设和算法实现层面构建新模型.在SAS/IML环境下完成了对模型演算过程的程序化,实现了对模型输出结果变异性和不确定性的拆分以及定量描述.运用该模型进行实例分析,并将结果与前人的研究结论作对比验证分析,结果表明:该模型输出的结果与前人结论具有很强的可比性、一致性,且能定量给出相应结果的变异性和不确定性,输出信息更为丰富.该模型基于合理的假设和可靠的算法构建,适用于中国农产品膳食暴露评估,可为中国农产品质量安全监管提供一定的参考依据....
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北大核心 CSTPCD CSCD AJ CA CBST
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摘要:等位基因的变异在各种生物中都是普遍存在的,并对基因的表达起着重要的调控作用.为了探索关联分析中品种数目(A)、平均等位基因多态信息含量(B)和候选基因总贡献率(C)对候选基因分析结果的影响,本研究采用经验贝叶斯(E-Bayes)方法探讨了上述因素对候选基因检测功效、遗传效应估计值的准确度和精确度以及假阳性出现频率等的影响.结果表明:(1)随着A、B和C的增加,候选基因的检测功效和效应估计值的准确度和精确度明显提高,假阳性出现的频率降低.(2)B对检测功效有显著的影响.在B值保持较高的水平时,即使品种的数目保持较低的水平以及候选基因的总贡献率较低时,平均检测功效也可达到80%;当B值为中等水平时,需要较大品种数目才能使平均统计功效超过80%;当B值较小时,品种数目即使达到100,3种贡献率水平下的统计功效最高也未达到50%.(3)B对候选基因效应估计值的准确度和精确度有显著的影响.随着B的增加,候选基因效应估计的准确度和精确度增加.(4)B因素对假阳性频率也有显著影响.在实例分析中检测到4个基因与稻米糊化温度显著关联.因此,在进行等位基因功能差异的统计遗传学分析时等位基因多态性是主要的影响因素,同时较多的品种数和较高的贡献率对候选基因的统计功效、效应估计值的准确度和精确度也有重要影响....
摘要:采用盆栽法评价了157份玉米自交系的苗期耐盐性,并利用115对SSR标记解析了耐盐自交系的群体遗传结构.结果表明,T5V、N1026、农大1145及4S等10份玉米自交系为高耐盐玉米种质;处理后10 d株高、地上鲜重、地下鲜重、地上干重、地下干重及存活率可作为玉米苗期耐盐鉴定的重要指标;利用SSR分子标记,结合系谱资料,将157份自交系划为6个类群,其中具有通系5血缘(类群Ⅰ)、泰国糯玉米种质血缘(类群Ⅲ)及旅大红骨、黄早四等血缘(类群Ⅵ)的自交系耐盐性较强,是开展玉米耐盐育种的重要种质类群.本研究筛选到的耐盐种质将为玉米耐盐遗传机制研究、玉米种质遗传改良及耐盐分子育种提供优异的基因资源....
摘要:为加强监测信息利用,提升我国农产品质量安全风险评估水平,本研究基于Monte Carlo和Bootstrap抽样方法,结合概率建模理论,提出了质量安全概率评估的U-V模拟分析方法,并在此基础上研发出基于Web应用技术的RAMA模型.实例分析结果表明,相对于@Risk和SAS软件,RAMA模型具有分析结果可信,执行效率较高,操作简便,便于推广应用等特点,可为农产品质量安全风险的决策与管理提供有益的参考....
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北大核心 CSTPCD CSCD CA CBST
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摘要:[目的]一般配合力(GCA)是评价亲本利用价值的重要指标.研究GCA的遗传基础及GCA相关QTL(QTLGCA)定位的可行性,为杂交育种提供技术参考.[方法]以双亲杂交衍生的重组自交系(RIL)为被测系、若干个随机选择的纯系为测验系的NCII交配设计以及QTL定位策略,系统研究GCA的遗传组成、影响QTLGCA定位的因素以及QTLGCA与性状本身QTL之间的关系.[结果]若性状受1对等位基因控制,RIL的GCA以及QTLGCA定位均与控制性状本身基因位点的加性效应、显性效应以及测验系等位基因的频率有关;若性状受2对加/显性的等位基因控制,则GCA估计及QTLGCA定位均与基因间是否连锁无关,其影响因素与性状受一个基因控制时相同;若性状受2对互作基因控制,GCA及QTLGCA定位均与测验系等位基因频率和性状本身QTL的主效应以及基因间互作效应有关,此外,GCA效应估计还与基因间是否连锁有关.[结论]无论是GCA效应估计还是QTLGCA定位,测验系等位基因频率和性状本身QTL效应大小都是重要的影响因素.此外,QTLGCA与性状本身QTL的差异还取决于性状的遗传结构以及QTL定位方法的选择....
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北大核心 CSTPCD CSCD
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摘要:R/qtl是基于R语言的QTL分析专用作图软件.为了研究R/qtl不同作图方法在分析结果上的差异,采用1个玉米F2∶3家系的株高实际数据,分别按该软件提供的区间作图法(IM)、复合区间作图法(CIM)、二维扫描和多QTL拟合进行数据分析和结果比较.在株高性状上共定位到8个QTL,其中,IM法检测到7个,总共解释表型变异的54.57%,有3个QTL在4种算法中都能检测到,其位置、LOD值、置信区间以及贡献率估计4种算法分析结果基本一致.CIM法共检测到5个QTL,可解释总变异的27.66%,其中,位于第3染色体158 cM和222 cM的2个QTL在所有4种算法中都能检测到,第7染色体36 cM处的QTL首次被检测到,其余4个QTL与IM法检测到的相应QTL一致.二维QTL扫描共检测到7个QTL,累计贡献率达到54.97%,未检测到显著互作的QTL,除第6染色体33.5 cM处的QTL外,其他QTL与IM法检测到的一致.多QTL拟合只检测到3个QTL,累计贡献率为21.52%,也未检测到QTL间显著互作.以上分析结果表明:不同方法检测到的QTL无论在数量上还是在贡献率估计上均存在一定程度上的差异,但一些主要QTL在用不同方法分析中通常都能被发现.此外,本研究群体株高性状的遗传模式仅有主效应QTL,上位性QTL均未检测到....
摘要:在梗稻品种台北309经60Co-γ辐射诱变的后代中发现了一份类树状突变体pla1-5,该突变体表现为植株矮化、叶片小且数量增多、分蘖数减少、高位分蘖、穗分化受阻等特征.遗传分析表明,该性状受一对隐性核基因控制.利用图位克隆技术将目的基因定位在第10染色体长臂上两个分子标记CHR1027和CHR1030之间,物理距离为58 kb,并与SSR标记CHR1028和CHR1029共分离.根据水稻基因组序列的注释,该区域内存在5个完整的预测基因.测序分析表明pla1-5突变体中一个编码细胞色素P450 CYP78A11的释义基因LOC_Os10g26340第1外显子内缺失了一个碱基T,导致移码突变和翻译提前终止.据此,初步推测细胞色素P450 CYP78A11基因为PLA1-5的候选基因....
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北大核心 CSTPCD CSCD CA CBST
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摘要:[目的]探讨实际问题研究中的不完全数据聚类.[方法]利用相关变量的辅助信息,对缺失数据进行推估,确定其合理的替代值,从而构造出一个“完全”数据集.在此基础上以EM算法循环迭代,参数的估计值和缺失数据的替代值都将逐渐收敛,以相应的贝叶斯后验概率判别个体的归类,进而实现动态聚类.[结果]模拟研究表明,缺值替代法具有较好的收敛性,对有缺失的数据基本都可正确地聚类.[结论]Fisher的鸢尾花花类识别数据验证了缺值替代法的可行性,其聚类的准确性高于缺值删除法,基本接近完全数据聚类....
摘要:溶剂保持力(SRC)是评价软麦品质的一项重要指标.为了解我国不同麦区小麦品种溶剂保持力的差异,2008—2009和2009—2010生长季测定了181个小麦品种的4种溶剂保持力,并分析其遗传变异及不同麦区品种SRC特点.结果表明,4种SRC值在品种、年度和麦区间均差异显著(P<0.01或P<0.05),此外,年份×品种和年份×麦区的互作效应也达显著水平(P<0.01).主成分分析表明,仅主成分1的特征值大于1.0,其对方差的解释率为72.3%;根据主成分综合得分对供试品种聚类,结果显示各麦区品种SRC值变异明显,存在不同SRC类型的品种资源,低SRC品种在长江中下游麦区相对较多,而中、高SRC品种多分布于黄淮麦区.筛选出阿勃、法展5号、淮麦17、宁麦3号、宁麦6号、皖麦48、选7、扬麦13、扬麦17、郑麦004等低SRC品种,可用于弱筋小麦品种选育和品质改良....
摘要:在粳稻品种武香粳9号来源的转基因后代中发现一份窄叶突变体,在整个生育期表现为叶片变窄且内卷,植株矮化.遗传分析表明,该窄叶性状受一对隐性核基因控制.以突变体和南京11杂交获得的F2为定位群体,利用分子标记进行基因定位,将窄叶基因定位在第12染色体长臂的SSR标记CHR1220和CHR1216之间,物理距离约为1.44 Mb,与标记CHR1217共分离.定位区段与nal3和nal3(t)等窄叶基因所在的染色体区域相同,故将所定位基因暂定名为nal3-t.这为进一步克隆该基因打下了基础....
摘要:采用强优势玉米杂交种苏玉16(JB×Y53)的两个亲本自交系,配置F2和相应F2∶3作图群体.利用154个SSR标记构建了分子标记连锁图谱,覆盖全基因组1 735.0 cM,标记间平均图距为11.3 cM.同时考察F2和F2∶3群体的株高、穗位高、抽穗期和散粉期等共10个重要农艺性状,采用联合F2和F2∶3群体的作图方法定位有关QTL.此外,采用QTL Cartographer V2.5软件分别对F2和F2∶3群体进行了有关QTL的重演性验证.结果表明,采用联合作图方法在调查的10个性状上共定位到93个QTL,采用QTL CartographerV2.5软件共定位到96个QTL,其中56个能用两种方法重演验证....
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