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扬州大学
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[期刊论文] 徐辰武
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北大核心
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1996 年
摘要:偏分离是指观察到的基因型比例偏离预期的孟德尔频率的分离方式,被逐渐认为是一种重要的进化动力,偏分离的主要原因是由生存力位点造成的配子和合子的生存力差异.然而,母体细胞质也可能参与配子和受精卵的生存力选择.该文的目的是定位玉米中的偏分离位点(SDL)并检验配子和合子的生存力是否与母体细胞质环境相关.在该研究中,以正反交构建的F2代分离群体为材料,构建了126个微卫星标记的遗传连锁图,并利用全基因组扫描检测不同母体细胞下分离群体的SDL,在供试的F2群体中共检测到14个显著的SDL.有趣的是,笔者发现在两个不同母体胞质背景下,SDL中的基因型频率发生了明显变化,这表明在不同的细胞质环境下,配子和合子的的生存力发生了变化.此外,JB细胞质背景下,大多数检测到的SDL和偏分离标记均偏向Y53,结果表明细胞质通过影响配子和合子的生存力选择,在F2代群体的偏分离模式中起了重要的作用....
[期刊论文] 敖雁 徐辰武
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北大核心 CSTPCD CSCD AJ CA CBST
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摘要:四向杂交(four-way cross)设计是指4个纯系亲本参与杂交衍生分离群体的一种交配设计.尽管国际上已经提出基于四向杂交设计的迭代重新加权最小平方(iteratively reweighed least squares,IRWLS)QTL作图方法,但该方法忽略了双侧标记基因型内QTL基因型的混合分布特性,当QTL位置和标记的位置不重合时作图精度较低.本文根据四向杂交设计的数量遗传模型,发展出基于四向杂交设计和混合分布理论的QTL作图的极大似然估计方法.首先利用染色体上所有标记基因型联合计算该染色体上任一假定位置QTL的条件概率,然后根据混合分布理论建立基于EM算法实现的QTL作图的极大似然估计方法.以计算机模拟数据研究了QTL遗传力、样本容量和分子标记信息含量3个因素对方法的影响,结果表明:(1)在QTL的被发现能力上,标记信息不完全的四向杂交设计仅略低于信息完全时的四向杂交设计;(2)随着QTL遗传力、样本容量和标记信息含量的增大,QTL位置以及效应估计值的准确度和精确度逐步提高....
[期刊论文] 敖雁 徐辰武
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北大核心 CSTPCD CSCD AJ CA
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摘要:以实例详述了运用贝叶斯统计进行线性回归分析的原理和方法, 并将其推广应用于F2群体的QTL作图. 该方法可同时实现对QTL基因型、位置、效应及模型剩余方差等参数的贝叶斯估计, 其可行性和有效性通过计算机模拟数据进行了分析验证. 结果表明: 尽管随着遗传力的提高, QTL位置和效应估计值的准确度随之提高,但在设定的3种遗传力(5%、 10%和20%)下相差不大, 均很准确; 而估计值的精确度则随着遗传力的提高而明显提高. 因此, 在QTL遗传力较低时, 为了提高QTL位置和效应估计的准确度与精确度, 适当的样本容量是必要的....
[期刊论文] 胡治球 徐辰武
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北大核心 CSTPCD CSCD CBST
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摘要:谷类作物胚乳性状的遗传表达, 可能同时受三倍体的胚乳基因型和二倍体的母体基因型控制. 然而, 迄今关于胚乳性状数量基因座(QTL)作图的统计方法均忽略了QTL可能存在的母体效应. 将二倍体母体性状的数量遗传模型与三倍体胚乳性状的数量遗传模型相结合, 提出一种新的包含母体效应的胚乳性状QTL区间作图方法. 该方法以分离群体中母株的DNA分子标记基因型以及母株上自交种子胚乳性状的单粒观察值为数据模式, 采用基于EM算法实现的极大似然分析方法进行胚乳性状QTL的区间作图. 由于该方法考虑到胚乳性状可能存在的母体QTL效应, 因此更加符合胚乳性状的遗传学本质, 并有助提高胚乳性状QTL作图精度. 其可行性通过计算机模拟研究得到了验证....
摘要:用美国国家标准和技术研究院(NIST)公布的各种类型数据,检验缩张算法拟合非线性方程的可行性. 结果表明:改进缩张算法的反馈系统,可方便和稳健地实现非线性模型的最优参数估计. 经检验还发现NIST公示结果尚有个别问题未达全局最优;由缩张算法获得的参数估值与NIST给出的估值基本一致或比之更优;用缩张算法实现全局最优拟合的难度和NIST的划分不尽相同;该算法对多自变数非线性方程同样有效....
[期刊论文] 敖雁 徐辰武 莫惠栋
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北大核心 CSTPCD CSCD AJ CA CBST
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摘要:以3个野败型雄性不育系(A)和10个恢复系(R)为材料,配成3×10=30个A×R杂种,研究籼型杂种稻谷9个品质性状的杂种优势表现.结果表明:(1)杂种的平均表现,在精米率(HP)、粒长(GL)、垩白度(CS)、直链淀粉含量(AC)和胶稠度(GC)上,都介于雌亲和雄亲平均数之间;在粒宽(GW)、粒重(WG)和碱扩值(ASV)上既大于雌亲又大于雄亲平均数;在出糙率(BP)上,既低于雌亲又低于雄亲平均数.(2)离中优势相当普遍,且有60.74%的性状-组合存在显著的离中优势,尤其是HP、GL 、GW、WG性状,离中优势显著的组合达77%~80%.(3)对于以高为优的性状,平均只有18.89%的性状-组合存在显著的超高亲优势,WG、GL、ASV、GC、HP和BP性状的显著超高亲组合数依次为16、7、4、4、3、0.对于以低为优的性状(GW、CS和AC),则只有7.78%的性状-组合存在显著的超低亲优势.说明籼稻谷品质性状的绝大多数性状-组合不存在超亲优势.(4)1×12(珍汕97A×双桂1号)在精米率、粒长、粒重和胶稠度4个性状上均表现显著超高亲优势,1×7(珍汕97A×密阳23)在精米率、粒长和粒重3个性状上都表现显著超高亲优势,为较好组合....
[期刊论文] 徐辰武 莫惠栋 敖雁
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北大核心 CSTPCD CA CBST
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摘要:采用胚乳性状质量-数量遗传的极大似然鉴别方法,进行质量-数量遗传模型测验和主、微基因效应与变异估计,以F2和F3胚乳世代为例详细演示了分析程序,将之应用于3个籼稻组合直链淀粉含量的遗传分析.结果表明,直链淀粉含量为一典型的胚乳质量-数量性状,由一个主基因和若干微基因共同控制;控制高、低和糯的主基因可能为一组复等位基因,且高对低、高对糯接近完全显性;微基因对直链淀粉含量的作用在不同组合可以是主基因变异尺度的1/2~1/4....
[期刊论文] 胡雅 潘亮 徐辰武
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北大核心 CSTPCD
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摘要:玉米Dwarf8基因是显性矮化基因,由于其突变体在DELLA区的碱基缺失而使其呈组成型表达抑制GA响应,从而表现出植株矮小,种子发芽率低,叶片呈暗绿色等特性。对玉米Dwarf8基因在来源广泛的96份玉米自交系中进行了目标序列重测序,并与株高和穗位高2个株型性状以及穗长、穗粗、轴粗、穗质量、行粒数、穗行数和粒质量7个穗部性状进行关联分析。 Dwarf8基因在供试玉米自交系中共有66个变异位点,包括18个SNP和48个InDel。在编码区发现24个变异位点,包括6个SNP和18个InDel位点。关联分析发现,玉米Dwarf8基因中1个非同义突变位点与株高显著关联,另外1个非同义突变位点与穗长显著关联。...
摘要:为进一步巩固和加强教学工作的中心地位,激发全体教师的教学热情,不断提高课堂教学质量,扬州大学自2007年以来,已连续开展了3届中青年教师讲课比赛。以2011年60名参赛教师比赛成绩为样本,分别以描述性统计、方差分析、多重比较和相关分析方法,对比赛结果进行分析评价,结果表明:选手间的讲课水平能够用比赛得分(有效成绩)进行较好的区分;虽然大部分评委对选手的看法比较一致,但评委判分中仍存在一些问题。进一步的探究可以找出少数评委判分存在较大差异的原因。研究表明,今后的评委判分工作、比赛奖项设置以及课堂教学质量提高路径等仍有改革余地。...
[期刊论文] 敖雁 徐辰武 莫惠栋
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北大核心 CSTPCD AJ CA SCIE CBST
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摘要:应用新近提出的p+q+pq交配设计的种子性状遗传表达鉴别方法,分析了籼型水稻3个不育系和10个恢复系配组的30个杂种F1植株上的F2种子及其亲本的9个稻米品质性状。结果表明:(1)粒长、粒宽、粒重、糙米率和完整精米率5个性状在F2米粒间没有发生遗传分离,它们的遗传受二倍体的母体基因型(F1植株)控制。(2)垩白率、直链淀粉含量、糊化温度和胶稠度4个性状则在F2米粒间有极显著的遗传分离,故主要受三倍体的胚乳基因型(F2种子)控制。(3)除糙米率和垩白率遗传力较低,受环境影响大,其余7个性状均具有较高的遗传力。除粒重外,其余8个性状的遗传变异均以加性为主,显性为次。...
摘要:《生物统计与试验设计》是农学、生物科学等专业重要的学科基础课。扬州大学《生物统计与试验设计》自2010年获批国家精品课程以来,坚持以学生为主体,以研究性教学为导向,通过多种形式的教学方式的有机结合,提高本科课堂教学的实效性和针对性,着力培养学生的科研素养和科技创新能力。该课程组建了精品资源共享课协同建设团队,从教学队伍、教材建设、教学目标、教学内容和教学方法以及教育质量与教学效果等方面不断加强课程建设,努力完成由国家精品课程向国家精品资源共享课的转型升级。...
[期刊论文] 敖雁 朱明星 徐辰武
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北大核心 CSTPCD CSCD AJ CA CBST
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摘要:在许多复杂情况下,贝叶斯统计方法比经典数理统计方法能更直接解决问题,且可有效整合部分先验信息,但其需要高强度计算的特性曾限制了其广泛应用.近几十年来,随着高速计算机的发展以及MCMC算法的不断提出,贝叶斯方法已被用于群体遗传学、分子进化、连锁作图和数量遗传学等研究领域,文章综述了数量遗传学中QTL作图的贝叶斯方法从简单到复杂的发展历程....
[硕士论文] 徐辰武
扬州大学;江苏农学院 1989(学位年度)
[期刊论文] 肖静 杨泽峰 徐辰武
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北大核心 CSTPCD CSCD CA CBST
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摘要:[目的]比较不同监督聚类方法的优劣及其适用场合.[方法]应用2种高斯混合模型聚类法(GMM)、K-最近邻居法(KNN)、二分类支持向量机器法(SVMs)以及5种多分类支持向量机器法(MC-SVMs),分别对计算机模拟数据以及两组实际微阵列数据进行聚类分析,采用假阳性(FP)、假阴性(FN)、聚类的准确性以及马修斯相关系数(MCC)等指标进行评价.[结果](1)对成千上万基因表达谱数据,在服从高斯分布条件下,2种GMM法聚类准确性最高,且在训练样本容量较小的情况下,GMM-II法聚类准确性优于GMM-I法.(2)相比较而言,多分类MC-SVMs法稳健性较高,适用性最广,其对高维数据不敏感.不仅适用于成千上万基因表达谱数据的聚类,而且适用于以成千上万基因作为指标对少数几十个样本的聚类.(3)几种MC-SVMs法的表现,在样本容量较大时,宜采用OVO和DAGSVM法;样本容量较小时,OVR、WW和CS法聚类准确性和MCC值较高;样本容量适中时,5种MC-SVMs表现一致.[结论]建议根据数据的特征以及试验需要,同时选用至少两种方法进行试算,以便获得最佳聚类结果....
摘要:介绍了如何利用Excel软件中的"规划求解"工具进行非线性方程的最优拟合以及应用注意事项.采用Gause的4组草履虫数据,研究了用Excel的"规划求解"工具进行非线性方程拟合的有效性,并以莫惠栋的<农业试验统计>一书中的12个非线性方程实例,比较了用Excel拟合与用常规线性转换方法拟合的差异,结果表明:用Excel进行非线性方程的拟合不仅简单易行、获得更优的参数估计,而且可以拟合各种复杂的非线性方程....
[期刊论文] 汤在祥 吴雯雯 徐辰武
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北大核心 CSTPCD CSCD CBST
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摘要:EM算法是在不完全信息资料下实现参数极大似然估计的一种通用方法.本文导出了双位点不同标记类型,包括共显性-共显性,共显性-显性和显性-显性3种模式下,估计遗传重组率的EM算法,以及获得重组率抽样方差的Bootstrap方法;并将之推广到部分个体缺失标记基因型(未检测到电泳谱带)下的重组率估计.通过大量Monte Carlo模拟研究发现:(1)连锁紧密时,样本容量对重组率的估计影响不大;连锁松散时,需要较大样本容量才可检测到连锁以及实现重组率的较精确估计.(2)用包含缺失标记的所有个体估计重组率比仅用其中的非缺失标记个体估计更准确,且可显著提高连锁检测的统计功效....
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