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CSTPCD 北大核心
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摘要:[目的]营发酵单胞菌属Dysgonomonas是黄翅大白蚁后肠的第二优势微生物.前期研究中,我们从黄翅大白蚁后肠分离出一种命名为大白蚁营发酵菌的新菌.为深入了解大白蚁营发酵菌在宿主白蚁体内发挥的作用和功能,有必要解析大白蚁营发酵菌的基因组序列信息.[方法]使用Illumina Miseq 测序平台获取该菌的全基因组序列,将其全基因组序列经过注释的基因蛋白质序列提交COG和KEGG数据库进行BLASTp比对分析,确定该菌潜在的重要酶类和代谢途径,并对个别纤维素酶活进行检测.[结果]大白蚁营发酵菌整个基因组大小为4655756 bp,GC含量为38.54%,DDBJ数据库登录号为BBXL01000001-BBXL01000078.生物信息学分析结果表明菌株大白蚁营发酵菌具有多个木质纤维素降解酶基因,且具备完整的木质纤维素降解和乙酸、乳酸生成通路.此外发现该菌株中存在与氮源代谢和抵御病原体相关的基因.[结论]本研究首次解析大白蚁营发酵菌的全基因组序列,了解其基因组基本特征,初步探讨了该菌降解木质纤维素的过程,为细菌协助宿主白蚁降解木质纤维素提供了理论基础,同时为该菌可能参与宿主白蚁氮源代谢和抵御病原体入侵提供了依据....
摘要:白蚁是木质纤维素的主要降解者,在森林生态系统碳氮循环过程中发挥着重要作用.白蚁肠道共生微生物主要包括原生生物、细菌、古菌和真菌.在白蚁对木质纤维素进行降解、发酵,从而产生乙酸、氢气和甲烷以及对氮的固定过程中,白蚁肠道共生微生物起着重要的作用.本文对白蚁肠道微生物的研究方法进行总结,概述了各种方法的优缺点,同时对肠道微生物的研究进展进行了总结,以期为白蚁肠道微生物的进一步研究和利用提供参考....
摘要:[目的]从培菌白蚁—黄翅大白蚁后肠微生物菌群中分离能降解几丁质的细菌.[方法]以胶体几丁质为唯一碳源,根据胶体几丁质水解透明圈的大小进行筛选.通过形态学、生理生化以及16S rRNA基因序列分析进行菌株鉴定.[结果]从黄翅大白蚁肠道中筛选到8株能够降解胶体几丁质的细菌,它们分别属于芽孢杆菌属(Bacillus)、短芽孢杆菌属(Brevibacillus)、纤维单胞菌属(Cellulomonas)、指孢囊菌属(Dactylosporangium)、黄杆菌属(Flavobacterium)、类芽孢杆菌属(Paenibacillus)、鞘氨醇单胞菌属(Sphingomonas)和寡养单胞菌属(Stenotrophomonas).8株菌均具有几丁质酶、β-葡萄糖苷酶和内切葡聚糖酶活性.[结论]从黄翅大白蚁后肠中获得8株能够降解胶体几丁质并具有其他碳水化合物降解酶活性的细菌,这一研究为了解白蚁肠道微生物协助白蚁消化食物机制提供了依据....
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CSTPCD 北大核心
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摘要:漆酶属于多铜氧化酶家族中的一种,广泛存在于昆虫、植物、真菌和细菌中.由于其作用的底物范围较广,因此在纺织、制浆、食品以及木质素的降解等方面有广阔的应用前景.但是自然界中的漆酶存在表达量和酶活低、高温易失活等问题,限制了它的应用.对漆酶进行大量高效的异源表达,是解决这一问题的有效途径.近年来,越来越多不同来源的漆酶基因被克隆,并在不同宿主中异源表达.但这些大多局限于实验室研究,还未达到工业化生产的水平.笔者对真核生物来源漆酶的异源表达研究进展进行综述,重点介绍了真核生物来源的漆酶在不同表达系统中的异源表达情况以及在酵母细胞中表达漆酶时提高表达量和酶活性能的方法,以期为研究者们提供参考....
摘要:白蚁在热带森林系统碳循环和氮循环中起重要作用.白蚁肠道中的微生物包括原生生物、细菌、古菌和真菌,帮助白蚁消化食物.本文主要概括近年来白蚁肠道微生物多样性研究方面的新进展,介绍白蚁肠道微生物的组成和作用.白蚁种类繁多,根据其后肠内是否含有原生生物,分为低等白蚁和高等白蚁两大类群.不同白蚁食性不同,其肠道微生物的组成也不同.白蚁肠道微生物对于宿主具有重要的作用,帮助宿主分解木质纤维素,发酵产生乙酸、甲烷和氢气(中间产物),除此之外,在热带以土壤为食白蚁的腐殖质矿化作用有助于氮循环.白蚁与微生物的共生关系是目前较受关注的研究热点,不仅有助于人们了解白蚁共生菌群落间的互作及其与宿主间的关系,而且可能为工业生产纤维素乙醇提供潜在的方法.分离鉴定方法和高通量测序技术的发展将有助于进一步深入了解白蚁肠道微生物的结构组成和功能....
[硕士论文] 孙新新
微生物学 山东大学 2017(学位年度)
摘要:白蚁能够高效降解木质纤维素,其降解木质纤维素的速率超过了木腐真菌和其他的食草动物。白蚁肠道中存在多种共生微生物,根据白蚁后肠有无鞭毛虫,将白蚁分为低等白蚁(有鞭毛虫)和高等白蚁(无鞭毛虫)两大类。高等白蚁根据食性分为食木/草白蚁、食土/腐殖质白蚁和培菌白蚁。
  培菌白蚁属于大白蚁亚科,其在菌巢中培养真菌鸡枞菌。在干旱的热带地区培菌白蚁可以降解90%以上的木质材料,所以培菌白蚁在碳循环中具有重要的作用。培菌白蚁和许多的微生物共同进化,不仅包括具有木质纤维素降解能力的鸡枞菌,还包括肠道共生微生物以及菌巢中的细菌。白蚁-真菌-共生微生物系统将木质纤维素彻底降解。为了探究白蚁肠道微生物如何帮助白蚁消化食物,本研究以培菌白蚁—黄翅大白蚁为研究材料,对其肠道微生物进行研究。
  首先,采用高通量测序的方法,比较分析了黄翅大白蚁前肠、中肠和后肠共生微生物(细菌、真菌和古菌)的多样性。分析结果发现,白蚁前肠和中肠的优势细菌菌门为Proteobacteria(变形菌门),后肠的优势细菌菌门为Bacteroidetes(拟杆菌菌门)、Firmicutes(厚壁菌门)和Proteobacteria(变形菌门);白蚁肠道的优势真菌菌门为Ascomycota(子囊菌门);白蚁肠道的古菌85%为未知古菌,鉴定到的古菌大多数与甲烷的产生有关。Alpha多样数指数表明,后肠细菌多样性高于中肠和前肠;中肠真菌多样性高于后肠和前肠;前肠古菌多样性高于中肠和后肠。黄翅大白蚁不同肠道区域的肠微生物菌群结构存在明显的差异。
  然后,利用传统的分离纯化方法,以几丁质为唯一碳源的培养基分离培养能够降解几丁质的后肠微生物。根据胶体几丁质水解圈的大小筛选可以降解几丁质的微生物。然后通过形态学、生理生化以及16S rRNA基因序列分析进行菌株鉴定。从黄翅大白蚁后肠中筛选到8株能够降解胶体几丁质的细菌,它们分别属于Flavobacterium(黄杆菌属)、Dactylosporangium(指孢囊菌属)、Brevibacillus(短芽孢杆菌属)、Sphingomonas(鞘氨醇单胞菌属)、Paenibacillus(类芽孢杆菌属)、Cellulomonas(纤维单胞菌属)、Stenotrophomonas(寡养单胞菌属)、Bacillus(芽孢杆菌属)。纯化的8株菌,均具有几丁质、EG和BG酶活。这一研究为了解白蚁肠道微生物协助白蚁消化食物机制提供了依据。
  最后,将第二部分得到的新菌Cellulomonas macrotermitis进行分类鉴定。
  本文以培菌白蚁黄翅大白蚁为研究材料,比较分析了黄翅大白蚁前肠、中肠和后肠微生物菌群结构的差异;从后肠中分离培养了8株能够降解几丁质的细菌,为肠道微生物协助白蚁降解食物提供了依据;对新菌Cellulomonasmacrotermitis进行了鉴定。通过上述研究表明,黄翅大白蚁肠道中存在许多的共生微生物,这些微生物在参与白蚁的碳代谢、氮代谢以及抵御病原体的侵染方面均具有潜在的作用,但具体作用还需进一步研究。
[硕士论文] 孙新新
概率论与数理统计 山东大学 2009(学位年度)
摘要:一维倒向随机微分方程是定义在[0,T]上下述形式的方程的方程:(公式略)。 这里(Bs)0≤t≤T为定义在完备概率空间(Ω,F,P)上的d-维标准布朗运动,{Ft,0≤t≤T}为布朗运动生成的标准信息族,即Ft完备且Ft=σ{Bs,0≤s≤t},函数g:Ω×[0,T]×R×Rd→R为方程(1.1)的生成元,T为终端时刻,取值于R的FT适应过程ξ为终端价值,(g,T,ξ)为方程的构成要素。其解(Yt,Zt)为(Ft)0≤t≤T上的循序可测过程。 非线性倒向随机微分方程(BSDEs)最早由Pardoux and Peng(1990)提出,他们证明了当方程的生成元g和终端价值ξ满足一定条件是方程的解存在唯一,其中最著名的条件是生成元g对y、Z满足Lipschitz-条件,终端价值ξ平方可积。从此以后,BSDEs引起了人们的广泛兴趣。特别的,人们对于放宽Lipschitz-条件做了大量的工作。Lepeltier and San Martin(1997)证明了当g对(y,z)只满足连续、线性增长条件时,方程的解存在;Kobylanski(2000)证明了当g连续、对z满足二次增长,终端价值ξ有界时,方程的解存在唯一。 与之相伴随的,EL.Karouri,Kapoudjian,Peng and Qenez(1997)年引入了倒向随机微分方程的反射方程理论(RBSDE)(单边):在标准倒向随机微分方程中附加了一个连续、单增过程,使得方程的解位于被称为下端反射(障碍)的连续有界过程的上方。更确切的说,RBSDE包括生成元g,终端价值ξ,连续边界L,其解为取值于R1+d+1的平方可积的适应过程,若记为(Yt,Zt,Kt),则其满足下述方程:(公式略)。论文中证明了当生成元g对(y,z)满足Lipschitz-条件时解的存在唯一性。随后,Matoussi(1997)证明了当g对y,z至多满足线性增长条件时,RBSDE存在极大解和极小解。 Cvitanic和Karatzas(1995)引入了倒向随机微分方程的双边放射方程理论。该方程是一个标准倒向随机微分中加入了两个连续、单增过程,这两个过程保证了方程的解在预先给定的下端反射(障碍)L和上端反射(障碍)U之间。并证明了当生成元g满足Lipschitz-条件时解的存在唯一性。 Jia(2006)证明了一维BSDEs解的广义存在定理,在该定理中,生成元g对y满足左-Lipschitz条件,对z满足Lipschitz-条件;随后,Zheng和Zhou(2008)证明了在Jia给定条件下RBSDE解的存在性。Jia和Xu(2006)又证明了当g对z-致连续时解的唯一性定理。 本文主要研究当生成元g对y满足左-Lipschitz条件,对z-致连续时,BSDEs以及RBSDEs解的存在性。
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