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[硕士论文] 于雯楠
微生物学 山东大学 2018(学位年度)
摘要:慢生单胞菌对其他细菌有捕食作用,对于海洋中慢生单胞菌的分布进行分析对微生物群落演替的研究、新药开发、以及渔业发展具有重要意义。本研究通过设计了可与沉积物慢生单胞菌FA350T(Bradymonas sediminis FA350T)特异性结合的探针,通过对其进行特异性验证,结果表明所设计的探针可以与沉积物慢生单胞菌FA350T特异性结合;以文登高岛盐场样品为研究对象,以高通量测序技术与荧光原位杂交技术相结合,探究了不同生活环境中沉积物慢生单胞菌的分布情况。
  研究发现:在九个样品中,同一盐度的样品,OTU数目,多样性丰富度均为下层泥最高,表层泥次之,水样中最低。盐度为60‰、110‰、150‰的样品中OTU数目依次减少,多样性依次降低。
  同一盐度样品群落丰富度由低到高的顺序为:水样、表层泥、下层泥;水样的微生物多样性低,泥样的微生物多样性较高。在九个样品中,表层泥与下层泥群落的丰度由高到低分别是盐度为60‰、110‰、150‰的样品。
  水样中未检测到慢生单胞菌。在表层泥样品中,慢生单胞菌的丰度从高到低依次是盐度为110‰、150‰、60‰的样品;在下层泥样品中,慢生单胞菌的丰度从高到低依次是盐度为150‰、110‰、60‰的样品。从垂直分布来看,盐度为60‰和盐度为150‰的样品中均为下层泥中慢生单胞菌群落丰度最高,而盐度为110‰的样品中,表层泥样品中的慢生单胞菌群落丰度最高。盐度为110‰表层泥样品在所有样品中慢生单胞菌群落丰度最高。可能由于在该环境中的盐度条件、慢生单胞菌生长所需的营养物质物质相对较多、该环境条件下的其他微生物群落组成结构等其他环境因素对慢生单胞菌生长有利,该结果为从盐场样品中分离得到慢生单胞菌提供了依据。
  同时,本论文完成了三株海洋新菌的多相分类:菌株2p52T分离自中国海南陵水县采集的红藻样品。菌株为革兰氏阴性,无运动性。呼吸醌的类型为Q-8。菌株菌株2p52T的主要脂肪酸为C16∶1ω7c and/or iso-C15∶02-OH、C16∶0、C18∶1ω7c。主要极性脂成分为磷脂乙酰醇胺、磷脂酰甘油。DNA G+C含量为43.2mol%。与其16S rRNA基因序列亲缘关系最接近的菌株是Agaribacter marinus NBRC110023T,相似性为96.5%。根据表型特征与系统发育分类结果,证明菌株2p52T为Agaribacter属的一个新物种,并将它命名为浅黄色嗜琼脂杆菌,拉丁名为Agaribacter flava。
  菌株QM202T分离自中国海南陵水县采集的红藻样品,菌株为革兰氏阴性,绝对好氧菌。主要极性脂为双磷脂酰甘油,磷脂酰甘油。主要脂肪酸为C16∶1ω7cand/or iso-C15∶02-OH,C16∶0,C18∶1ω7c。主要呼吸醌为Q-8。DNA G+C含量为41.31mol%。其16S rRNA基因序列与Marinomonas pontica DSM17793T相似度最高,为96.0%。根据表型特征与系统发育分类结果,证明菌株QM202T为海单胞菌属的一个新物种,并将它命名为噬琼脂海单胞菌,拉丁名为Marinomonas agarovorans。
  菌株XAY1247T分离自威海近海沉积物。菌株为短棒状。菌株XAY1247T主要脂肪酸为C18∶1ω7c、C12∶13-OH;主要呼吸醌为Q-10;主要极性脂为1种未知磷脂、1种未知脂质、双磷脂酰甘油。DNA G+C含量为62.9mol%。根据表型特征与系统发育分类结果,证明菌株XAY1247T为Roseovarius属的一个新物种,并将它命名为短杆状玫瑰变色菌,拉丁名为Roseovarius brevitalea。菌株XAY1247T16SrRNA基因序列相似性值为99.7%。菌株XAY1247T与Roseovarius属中亲缘关系最相近的菌株的16S rRNA基因序列的相似性为96.7%。根据表型特征与系统发育分类结果,证明菌株XAY1247T属于Roseovarius属,并将XAY1247T命名为短杆状玫瑰变色菌,拉丁名为Roseovarius brevitalea。
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